Protein–RNA interactions for Protein: P30260

CDC27, Cell division cycle protein 27 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 824 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC27P30260 XRCC6-202ENST00000360079 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDC27P30260 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDC27P30260 PPP1R26P4-201ENST00000619065 3527 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CDC27P30260 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDC27P30260 RPS6KA4-201ENST00000334205 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDC27P30260 ZNF576-202ENST00000391965 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDC27P30260 RPL13AP3-202ENST00000494676 1473 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CDC27P30260 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDC27P30260 KIAA1614-AS1-201ENST00000415647 1440 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDC27P30260 DNER-201ENST00000341772 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDC27P30260 L2HGDH-201ENST00000261699 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDC27P30260 BRMS1-202ENST00000425825 1363 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDC27P30260 SDC1-201ENST00000254351 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDC27P30260 PGRMC1-201ENST00000217971 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDC27P30260 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDC27P30260 FRMPD2B-201ENST00000431305 1347 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CDC27P30260 LIPA-202ENST00000336233 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDC27P30260 RAP1GAP-211ENST00000495204 2489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDC27P30260 ADARB2-AS1-201ENST00000381301 625 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDC27P30260 XG-202ENST00000419513 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDC27P30260 TAC3-208ENST00000441881 731 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDC27P30260 AC005077.2-201ENST00000449786 690 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CDC27P30260 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDC27P30260 TAC3-211ENST00000615887 1120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDC27P30260 AC091544.8-201ENST00000619490 361 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CDC27P30260 ELN-210ENST00000380584 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDC27P30260 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDC27P30260 SERPINF1-201ENST00000254722 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDC27P30260 SPERT-204ENST00000610924 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDC27P30260 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDC27P30260 AC239799.1-201ENST00000612520 3411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDC27P30260 MYD88-203ENST00000417037 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDC27P30260 GRM7-215ENST00000486284 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDC27P30260 ATG13-215ENST00000529655 2566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDC27P30260 FAAP100-201ENST00000327787 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDC27P30260 OPRM1-201ENST00000229768 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDC27P30260 ERLIN1-202ENST00000407654 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDC27P30260 OPRM1-207ENST00000428397 1481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDC27P30260 RCC2P1-201ENST00000452257 1476 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CDC27P30260 ATE1-201ENST00000224652 4930 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDC27P30260 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDC27P30260 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDC27P30260 CETP-203ENST00000566128 1733 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDC27P30260 LIG1-202ENST00000427526 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDC27P30260 MAGED4B-211ENST00000497164 2482 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDC27P30260 BARX1-AS1-201ENST00000453045 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDC27P30260 BCL2L12-211ENST00000614495 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDC27P30260 AC005014.1-201ENST00000432006 2976 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CDC27P30260 GUCY1B2-205ENST00000532104 1912 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDC27P30260 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDC27P30260 MTSS1-216ENST00000524090 2166 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDC27P30260 TAGLN-207ENST00000532870 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDC27P30260 CDK11A-201ENST00000356200 2653 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDC27P30260 KIRREL2-203ENST00000360202 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CDC27P30260 YTHDF2-201ENST00000373812 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CDC27P30260 PITRM1-206ENST00000451104 3183 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CDC27P30260 SLC19A2-201ENST00000236137 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CDC27P30260 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CDC27P30260 SLC9B2-202ENST00000394785 3126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CDC27P30260 PDE2A-203ENST00000418754 2855 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CDC27P30260 ZNF815P-201ENST00000421890 1352 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CDC27P30260 SARS2-202ENST00000430193 1886 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CDC27P30260 TMEM200A-204ENST00000617887 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CDC27P30260 ELP4-228ENST00000640954 1612 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CDC27P30260 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CDC27P30260 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CDC27P30260 ADAM12-201ENST00000368676 3313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CDC27P30260 CDYL2-203ENST00000562812 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CDC27P30260 CDYL2-204ENST00000563890 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CDC27P30260 CDYL2-205ENST00000566173 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CDC27P30260 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CDC27P30260 TNNI1-201ENST00000336092 1750 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CDC27P30260 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CDC27P30260 SEPT9-220ENST00000588690 2919 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CDC27P30260 CRACR2A-203ENST00000440314 2697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CDC27P30260 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CDC27P30260 CRYBA4-201ENST00000354760 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CDC27P30260 TMEM216-202ENST00000398979 908 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CDC27P30260 KRTAP19-9P-201ENST00000421795 191 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CDC27P30260 DNAJC27-AS1-207ENST00000451291 488 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CDC27P30260 CLDN11-207ENST00000486975 1139 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CDC27P30260 AGTRAP-212ENST00000510878 849 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CDC27P30260 LINC02380-201ENST00000510956 1038 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CDC27P30260 AC005920.3-202ENST00000512717 789 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CDC27P30260 RERG-205ENST00000537647 935 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CDC27P30260 AC026495.1-203ENST00000557528 906 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CDC27P30260 LINC01726-201ENST00000624692 1253 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CDC27P30260 SMOC2-202ENST00000356284 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CDC27P30260 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CDC27P30260 NOB1-201ENST00000268802 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CDC27P30260 CASP8-202ENST00000264275 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CDC27P30260 ATP6V0E2-207ENST00000479613 1666 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CDC27P30260 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CDC27P30260 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CDC27P30260 ADAM15-203ENST00000356955 2949 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CDC27P30260 PPT1-203ENST00000433473 2267 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CDC27P30260 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDC27P30260 PDZD7-206ENST00000619208 4135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDC27P30260 CETP-201ENST00000200676 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDC27P30260 CD48-201ENST00000368045 1793 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61 ms