Protein–RNA interactions for Protein: P28070

PSMB4, Proteasome subunit beta type-4, humanhuman

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB4P28070 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PSMB4P28070 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PSMB4P28070 GTF2A2-205ENST00000396064 633 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PSMB4P28070 SERPINE3-201ENST00000400389 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PSMB4P28070 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
PSMB4P28070 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
PSMB4P28070 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
PSMB4P28070 GTF2A2-208ENST00000484743 408 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PSMB4P28070 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PSMB4P28070 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PSMB4P28070 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PSMB4P28070 AL512310.5-201ENST00000551999 515 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
PSMB4P28070 GFER-204ENST00000567719 483 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PSMB4P28070 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PSMB4P28070 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PSMB4P28070 KIRREL2-203ENST00000360202 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PSMB4P28070 ASB3-201ENST00000263634 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PSMB4P28070 NCBP2-206ENST00000447325 2216 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PSMB4P28070 ASGR1-201ENST00000269299 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PSMB4P28070 FGD6-203ENST00000546711 4568 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PSMB4P28070 GABPA-202ENST00000400075 4814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PSMB4P28070 CD93-201ENST00000246006 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PSMB4P28070 LRP10-203ENST00000546834 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PSMB4P28070 DDC-207ENST00000444124 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PSMB4P28070 ATG9A-204ENST00000409422 2512 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PSMB4P28070 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PSMB4P28070 CYB5D2-203ENST00000575251 1588 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PSMB4P28070 SUV39H2-201ENST00000313519 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PSMB4P28070 MAGI3-202ENST00000369611 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PSMB4P28070 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PSMB4P28070 FAM90A7P-201ENST00000382628 1395 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
PSMB4P28070 FAM90A23P-201ENST00000400136 1395 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
PSMB4P28070 SGCE-202ENST00000415788 1871 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PSMB4P28070 LILRB5-203ENST00000449561 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PSMB4P28070 GOLGA8IP-202ENST00000611635 2100 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
PSMB4P28070 ATRN-202ENST00000446916 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PSMB4P28070 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PSMB4P28070 PLIN3-207ENST00000592528 2154 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
PSMB4P28070 C11orf21-201ENST00000381153 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
PSMB4P28070 AC090826.2-201ENST00000568496 4946 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
PSMB4P28070 TAF9-202ENST00000328663 1461 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PSMB4P28070 KLHL21-201ENST00000377658 4487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PSMB4P28070 ERICH6-201ENST00000295910 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PSMB4P28070 TPM3P9-201ENST00000424846 2920 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PSMB4P28070 PCMTD2-204ENST00000369758 3212 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PSMB4P28070 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PSMB4P28070 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
PSMB4P28070 PKIG-201ENST00000349959 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PSMB4P28070 DUSP13-202ENST00000372700 781 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PSMB4P28070 CASC10-201ENST00000377113 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PSMB4P28070 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PSMB4P28070 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PSMB4P28070 AC092580.1-201ENST00000433998 658 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
PSMB4P28070 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
PSMB4P28070 DUSP13-206ENST00000472493 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PSMB4P28070 AC009487.3-201ENST00000505579 560 ntTSL 4 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PSMB4P28070 AC011603.2-203ENST00000547387 897 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PSMB4P28070 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PSMB4P28070 ADGRE3-204ENST00000595472 486 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PSMB4P28070 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PSMB4P28070 HDAC7-209ENST00000427332 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PSMB4P28070 LDB3-207ENST00000542786 1889 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PSMB4P28070 USP39-220ENST00000613444 2161 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PSMB4P28070 TNK2-202ENST00000381916 4223 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PSMB4P28070 PGLYRP2-201ENST00000292609 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PSMB4P28070 AHCYP4-201ENST00000419201 1315 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
PSMB4P28070 CTSW-204ENST00000528419 1341 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PSMB4P28070 PCDH10-203ENST00000618019 4574 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PSMB4P28070 RPS6KC1-201ENST00000366959 5454 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PSMB4P28070 RPS6KC1-202ENST00000366960 5490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PSMB4P28070 ZNF135-205ENST00000511556 2253 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PSMB4P28070 KCNN3-202ENST00000358505 1658 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PSMB4P28070 SNX19-213ENST00000534726 1656 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PSMB4P28070 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
PSMB4P28070 PLSCR1-214ENST00000487389 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PSMB4P28070 SMAGP-203ENST00000603798 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PSMB4P28070 JPH3-201ENST00000284262 3985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PSMB4P28070 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PSMB4P28070 PCDHB16-201ENST00000609684 5001 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PSMB4P28070 OSBPL3-201ENST00000313367 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PSMB4P28070 C14orf39-201ENST00000321731 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PSMB4P28070 EVC2-201ENST00000310917 4828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PSMB4P28070 ESPN-201ENST00000377828 3531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PSMB4P28070 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PSMB4P28070 BSDC1-205ENST00000446293 1505 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PSMB4P28070 AC004997.1-205ENST00000447976 1851 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PSMB4P28070 PPP6R2-203ENST00000395741 3304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PSMB4P28070 AP002353.1-201ENST00000528257 1599 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
PSMB4P28070 INF2-209ENST00000617571 2956 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PSMB4P28070 TMEM40-201ENST00000264728 984 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PSMB4P28070 FUNDC2P2-201ENST00000331369 1223 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PSMB4P28070 XBP1P1-201ENST00000436573 652 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
PSMB4P28070 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
PSMB4P28070 HLA-J-204ENST00000495278 958 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
PSMB4P28070 AL355310.3-201ENST00000526411 582 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PSMB4P28070 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PSMB4P28070 AL132709.1-203ENST00000555103 569 ntTSL 4 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PSMB4P28070 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PSMB4P28070 AC140658.4-201ENST00000561990 352 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
PSMB4P28070 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
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