Protein–RNA interactions for Protein: P23327

HRC, Sarcoplasmic reticulum histidine-rich calcium-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HRCP23327 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HRCP23327 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HRCP23327 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HRCP23327 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HRCP23327 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HRCP23327 BX324167.2-201ENST00000623717 3316 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
HRCP23327 ATP6V0A4-202ENST00000353492 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HRCP23327 GTF2IRD1P1-202ENST00000457166 2426 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HRCP23327 LINC00299-202ENST00000442956 2342 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HRCP23327 GRIN1-204ENST00000371553 3751 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HRCP23327 PLEKHB2-206ENST00000409612 2210 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HRCP23327 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HRCP23327 SNCA-204ENST00000394989 3167 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HRCP23327 LINC01019-201ENST00000505443 3199 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HRCP23327 MARK2P9-201ENST00000430958 1727 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
HRCP23327 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HRCP23327 AC144450.1-201ENST00000366424 1641 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HRCP23327 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HRCP23327 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HRCP23327 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HRCP23327 MSH2-206ENST00000543555 3024 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HRCP23327 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HRCP23327 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HRCP23327 YWHAQ-202ENST00000381844 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HRCP23327 CARS-AS1-201ENST00000499962 2664 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HRCP23327 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HRCP23327 GPR84-202ENST00000551809 2041 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HRCP23327 TNN-202ENST00000621086 4234 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HRCP23327 MYCBP-201ENST00000397572 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HRCP23327 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HRCP23327 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HRCP23327 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HRCP23327 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HRCP23327 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HRCP23327 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HRCP23327 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HRCP23327 MIR6074-201ENST00000612054 107 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
HRCP23327 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
HRCP23327 AAAS-202ENST00000394384 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HRCP23327 FURIN-206ENST00000610579 4191 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HRCP23327 TBC1D2-204ENST00000375066 3198 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HRCP23327 ASS1-203ENST00000372393 1548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HRCP23327 WIZ-203ENST00000545156 4466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HRCP23327 SPACA9-202ENST00000356311 2243 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HRCP23327 TRIM80P-201ENST00000455685 2848 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
HRCP23327 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HRCP23327 POPDC2-201ENST00000264231 1679 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HRCP23327 MPZL2-201ENST00000278937 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HRCP23327 SERPINI1-201ENST00000295777 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HRCP23327 BIRC2-208ENST00000532672 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HRCP23327 SLC5A5-201ENST00000222248 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HRCP23327 RGL4-202ENST00000401461 2420 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HRCP23327 SLC35A4-203ENST00000612662 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HRCP23327 SNX25-201ENST00000264694 3264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HRCP23327 AC036108.2-201ENST00000566974 2562 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HRCP23327 PROKR1-201ENST00000303786 4273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HRCP23327 HNRNPH1-202ENST00000356731 3667 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HRCP23327 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HRCP23327 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HRCP23327 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HRCP23327 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HRCP23327 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HRCP23327 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
HRCP23327 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HRCP23327 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HRCP23327 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
HRCP23327 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HRCP23327 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HRCP23327 SIRPA-202ENST00000358771 3996 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HRCP23327 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HRCP23327 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HRCP23327 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HRCP23327 PTPRH-202ENST00000376350 3877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HRCP23327 PSD-202ENST00000406432 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HRCP23327 PDZRN3-208ENST00000479530 2778 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HRCP23327 LILRB2-202ENST00000391746 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HRCP23327 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HRCP23327 HINT3-201ENST00000229633 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HRCP23327 DDC-214ENST00000622873 1839 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HRCP23327 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HRCP23327 AC126335.2-201ENST00000623362 4637 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
HRCP23327 COL16A1-202ENST00000373668 3643 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HRCP23327 SLC8A2-203ENST00000542837 3603 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HRCP23327 ING4-201ENST00000341550 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HRCP23327 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HRCP23327 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HRCP23327 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HRCP23327 MPRIP-202ENST00000341712 3846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HRCP23327 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HRCP23327 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
HRCP23327 ADAM8-201ENST00000415217 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HRCP23327 STIM1-201ENST00000300737 4038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HRCP23327 ENOX1-201ENST00000261488 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HRCP23327 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HRCP23327 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HRCP23327 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HRCP23327 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HRCP23327 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HRCP23327 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HRCP23327 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.1 ms