Protein–RNA interactions for Protein: P20396

TRH, Pro-thyrotropin-releasing hormone, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 242 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRHP20396 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRHP20396 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRHP20396 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRHP20396 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRHP20396 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRHP20396 OR3A2-205ENST00000641164 2033 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRHP20396 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRHP20396 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRHP20396 RBM4-202ENST00000396053 1337 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRHP20396 GRIK4-208ENST00000638419 3593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRHP20396 SEC61B-201ENST00000223641 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRHP20396 IGFL1-201ENST00000437936 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRHP20396 AC116347.1-201ENST00000442824 720 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
TRHP20396 FHIT-205ENST00000476844 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRHP20396 SEC61B-203ENST00000498603 587 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRHP20396 LIAS-205ENST00000509519 1005 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRHP20396 ACTR6P1-201ENST00000514311 1104 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
TRHP20396 SLC16A7-209ENST00000549465 537 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRHP20396 B9D1-213ENST00000575403 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRHP20396 AL109983.1-201ENST00000603234 646 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
TRHP20396 FXYD3-207ENST00000604255 780 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRHP20396 AL590094.1-206ENST00000635959 478 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRHP20396 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRHP20396 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRHP20396 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRHP20396 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRHP20396 STK16-202ENST00000409260 1493 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRHP20396 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRHP20396 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRHP20396 TBC1D3P1-201ENST00000590047 1693 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
TRHP20396 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRHP20396 LIMS2-206ENST00000409754 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRHP20396 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRHP20396 HLA-DQA1-201ENST00000343139 1591 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRHP20396 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRHP20396 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRHP20396 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRHP20396 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRHP20396 SDCBP2P1-201ENST00000416115 614 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
TRHP20396 GGT8P-201ENST00000418938 532 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
TRHP20396 AC073310.1-201ENST00000423226 1033 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
TRHP20396 FAM9B-203ENST00000428477 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRHP20396 ENTPD1-AS1-210ENST00000452942 864 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRHP20396 SEMA6A-AS1-206ENST00000514214 782 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRHP20396 AC078878.2-201ENST00000543451 286 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRHP20396 LINC00514-203ENST00000573465 313 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRHP20396 AC005154.1-202ENST00000578293 999 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRHP20396 AC005828.3-201ENST00000583552 591 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRHP20396 AC025165.5-201ENST00000602802 578 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
TRHP20396 AL158050.2-201ENST00000605336 568 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
TRHP20396 METTL15-211ENST00000634762 718 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRHP20396 ATXN10-212ENST00000640901 1185 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRHP20396 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRHP20396 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRHP20396 FCRL6-201ENST00000321935 1997 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRHP20396 PHTF2-204ENST00000415251 1738 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRHP20396 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRHP20396 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRHP20396 SMUG1-220ENST00000513838 2119 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRHP20396 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRHP20396 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRHP20396 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRHP20396 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRHP20396 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRHP20396 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRHP20396 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRHP20396 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRHP20396 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRHP20396 WDSUB1-201ENST00000358147 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRHP20396 LINC01763-201ENST00000425185 1547 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRHP20396 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRHP20396 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRHP20396 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRHP20396 REG3A-201ENST00000305165 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRHP20396 RNASE8-201ENST00000308227 634 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRHP20396 TSACC-203ENST00000368253 512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRHP20396 TRMT13-201ENST00000370139 711 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRHP20396 AKR1B1P4-201ENST00000426552 922 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
TRHP20396 AC079250.1-201ENST00000456046 531 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
TRHP20396 PRAMEF35P-201ENST00000458709 891 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
TRHP20396 AC113346.2-201ENST00000502684 457 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRHP20396 DHRS4L1-201ENST00000558293 855 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRHP20396 AC005586.2-201ENST00000563946 837 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
TRHP20396 SNRPD2-203ENST00000585392 379 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRHP20396 AC026120.2-201ENST00000617239 309 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
TRHP20396 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRHP20396 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRHP20396 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRHP20396 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRHP20396 BORCS8-202ENST00000462790 1429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRHP20396 IFNAR2-201ENST00000342101 2606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRHP20396 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRHP20396 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRHP20396 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRHP20396 FXYD6-207ENST00000527717 1799 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRHP20396 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRHP20396 AC005519.2-201ENST00000554532 1367 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRHP20396 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRHP20396 NLK-203ENST00000582037 1503 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRHP20396 CLUHP3-207ENST00000563678 1303 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
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