Protein–RNA interactions for Protein: P17480

UBTF, Nucleolar transcription factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 764 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBTFP17480 MCRS1-201ENST00000343810 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
UBTFP17480 FAM86B1-203ENST00000448228 2096 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
UBTFP17480 ACAD8-201ENST00000281182 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
UBTFP17480 CHIT1-202ENST00000367229 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
UBTFP17480 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
UBTFP17480 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
UBTFP17480 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
UBTFP17480 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
UBTFP17480 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
UBTFP17480 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
UBTFP17480 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.27
UBTFP17480 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
UBTFP17480 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
UBTFP17480 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
UBTFP17480 DDX39A-201ENST00000242776 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
UBTFP17480 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
UBTFP17480 HERPUD1-203ENST00000379792 1782 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
UBTFP17480 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
UBTFP17480 PPP1R1B-202ENST00000394265 1419 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
UBTFP17480 SKA1-202ENST00000398452 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
UBTFP17480 TMEM177-202ENST00000401466 1346 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
UBTFP17480 GSTT2-201ENST00000402588 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
UBTFP17480 KRT8P18-201ENST00000413425 1445 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
UBTFP17480 PPP1R2P4-201ENST00000424051 595 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
UBTFP17480 AL354861.1-201ENST00000445213 355 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
UBTFP17480 LYRM4-206ENST00000468929 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
UBTFP17480 IKBKB-212ENST00000519735 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
UBTFP17480 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
UBTFP17480 OR5BD1P-201ENST00000532527 817 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
UBTFP17480 CR383656.3-201ENST00000551315 183 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
UBTFP17480 LETMD1-235ENST00000552739 1713 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
UBTFP17480 C12orf73-210ENST00000552940 685 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
UBTFP17480 VIPAS39-208ENST00000556412 1832 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
UBTFP17480 AC010422.5-201ENST00000597961 585 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
UBTFP17480 HIST1H3F-201ENST00000618052 411 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
UBTFP17480 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
UBTFP17480 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
UBTFP17480 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
UBTFP17480 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
UBTFP17480 PKD1P6-NPIPP1-202ENST00000605794 2902 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
UBTFP17480 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
UBTFP17480 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
UBTFP17480 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
UBTFP17480 C7orf57-201ENST00000348904 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
UBTFP17480 LTF-202ENST00000417439 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
UBTFP17480 SARS-202ENST00000369923 1882 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
UBTFP17480 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
UBTFP17480 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
UBTFP17480 GOT2-202ENST00000434819 1615 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
UBTFP17480 OXA1L-212ENST00000604262 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
UBTFP17480 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
UBTFP17480 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
UBTFP17480 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
UBTFP17480 ZNF333-209ENST00000601134 1392 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
UBTFP17480 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
UBTFP17480 PIP4K2A-201ENST00000323883 1319 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
UBTFP17480 HTR3E-203ENST00000425359 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
UBTFP17480 ACYP1-201ENST00000238618 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
UBTFP17480 LEMD1-205ENST00000367154 786 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
UBTFP17480 RN7SKP109-201ENST00000410592 316 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
UBTFP17480 AC145207.1-201ENST00000415556 691 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
UBTFP17480 AC098934.1-203ENST00000442868 1262 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
UBTFP17480 SLC25A15P3-201ENST00000505530 290 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
UBTFP17480 LINC02176-201ENST00000569104 598 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
UBTFP17480 AC007952.4-201ENST00000573866 637 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
UBTFP17480 MIR6727-201ENST00000620702 65 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
UBTFP17480 AL161773.1-201ENST00000624845 863 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
UBTFP17480 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
UBTFP17480 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
UBTFP17480 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
UBTFP17480 SLC20A2-207ENST00000520179 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
UBTFP17480 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
UBTFP17480 METTL13-202ENST00000362019 3022 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
UBTFP17480 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
UBTFP17480 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
UBTFP17480 ABAT-215ENST00000569156 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
UBTFP17480 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
UBTFP17480 LGALS12-204ENST00000415491 1816 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
UBTFP17480 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
UBTFP17480 ANKRD42-201ENST00000260047 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
UBTFP17480 IL9RP3-201ENST00000442856 1674 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
UBTFP17480 ZNF556-202ENST00000586426 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
UBTFP17480 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
UBTFP17480 EDNRB-204ENST00000626030 1571 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
UBTFP17480 ANKDD1A-202ENST00000395720 1518 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
UBTFP17480 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
UBTFP17480 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
UBTFP17480 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
UBTFP17480 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
UBTFP17480 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
UBTFP17480 NAXD-201ENST00000309957 2659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
UBTFP17480 CASC2-202ENST00000426021 3232 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
UBTFP17480 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
UBTFP17480 PSMB10-201ENST00000358514 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
UBTFP17480 TOMM20L-201ENST00000360945 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
UBTFP17480 S100A2-203ENST00000368709 457 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
UBTFP17480 CXCL12-202ENST00000374426 470 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
UBTFP17480 FAM3B-203ENST00000398647 864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
UBTFP17480 FAM3B-204ENST00000398652 1125 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
UBTFP17480 PSMG3-203ENST00000404674 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms