Protein–RNA interactions for Protein: P0DMW5

SMIM10L2B, Small integral membrane protein 10-like protein 2B, humanhuman

Predictions only

Length 78 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM10L2BP0DMW5 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMIM10L2BP0DMW5 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMIM10L2BP0DMW5 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMIM10L2BP0DMW5 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMIM10L2BP0DMW5 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMIM10L2BP0DMW5 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMIM10L2BP0DMW5 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SMIM10L2BP0DMW5 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMIM10L2BP0DMW5 OBSCN-AS1-201ENST00000295012 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMIM10L2BP0DMW5 PGAM2-201ENST00000297283 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMIM10L2BP0DMW5 PLA2G12B-201ENST00000373032 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMIM10L2BP0DMW5 CUTA-203ENST00000374500 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMIM10L2BP0DMW5 HCG9-201ENST00000376800 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMIM10L2BP0DMW5 AL391839.2-201ENST00000412085 383 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMIM10L2BP0DMW5 HTATIP2-202ENST00000421577 886 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMIM10L2BP0DMW5 AC025186.1-201ENST00000478174 870 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SMIM10L2BP0DMW5 ZSCAN2-208ENST00000485222 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMIM10L2BP0DMW5 CD59-210ENST00000528700 652 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMIM10L2BP0DMW5 ZSCAN2-210ENST00000538076 1109 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMIM10L2BP0DMW5 ZNF268-210ENST00000541211 781 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMIM10L2BP0DMW5 DUXAP9-201ENST00000547220 665 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMIM10L2BP0DMW5 AC023825.2-201ENST00000562970 672 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMIM10L2BP0DMW5 INCA1-203ENST00000575780 1221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMIM10L2BP0DMW5 TRMT112P3-201ENST00000580149 358 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SMIM10L2BP0DMW5 AC011247.3-201ENST00000603297 438 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SMIM10L2BP0DMW5 AC012073.1-201ENST00000606114 1108 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SMIM10L2BP0DMW5 AL031673.1-201ENST00000611460 466 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SMIM10L2BP0DMW5 TUBB8P4-201ENST00000511806 1324 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SMIM10L2BP0DMW5 CCL18-201ENST00000616054 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMIM10L2BP0DMW5 FUCA1P1-201ENST00000374476 1351 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SMIM10L2BP0DMW5 RPL18A-205ENST00000600147 1391 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMIM10L2BP0DMW5 ASGR1-209ENST00000619926 1384 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMIM10L2BP0DMW5 METTL7B-201ENST00000394252 1506 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMIM10L2BP0DMW5 LUC7L2-208ENST00000541170 1525 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMIM10L2BP0DMW5 CDK3-201ENST00000425876 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMIM10L2BP0DMW5 NIPA1-207ENST00000561183 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMIM10L2BP0DMW5 GOLGA8UP-201ENST00000527159 1755 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SMIM10L2BP0DMW5 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMIM10L2BP0DMW5 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMIM10L2BP0DMW5 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMIM10L2BP0DMW5 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMIM10L2BP0DMW5 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMIM10L2BP0DMW5 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMIM10L2BP0DMW5 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMIM10L2BP0DMW5 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMIM10L2BP0DMW5 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMIM10L2BP0DMW5 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMIM10L2BP0DMW5 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMIM10L2BP0DMW5 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMIM10L2BP0DMW5 HPSE2-206ENST00000628193 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMIM10L2BP0DMW5 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMIM10L2BP0DMW5 SLC47A1-206ENST00000571335 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMIM10L2BP0DMW5 TMEM14C-201ENST00000229563 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMIM10L2BP0DMW5 BCL2L11-202ENST00000337565 720 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMIM10L2BP0DMW5 ZNRD1-203ENST00000376782 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMIM10L2BP0DMW5 TRBV7-3-201ENST00000390361 397 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMIM10L2BP0DMW5 MIR1227-201ENST00000408484 88 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SMIM10L2BP0DMW5 AL590093.1-201ENST00000416119 623 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMIM10L2BP0DMW5 AC005486.1-201ENST00000466775 216 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMIM10L2BP0DMW5 AC100858.1-201ENST00000514059 1228 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SMIM10L2BP0DMW5 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMIM10L2BP0DMW5 TROAP-213ENST00000550709 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMIM10L2BP0DMW5 BATF-202ENST00000555504 361 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMIM10L2BP0DMW5 AC013553.1-201ENST00000560906 267 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SMIM10L2BP0DMW5 SNHG15-205ENST00000580458 710 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMIM10L2BP0DMW5 AC005357.2-202ENST00000590507 1060 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SMIM10L2BP0DMW5 ASNA1-205ENST00000611688 1214 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMIM10L2BP0DMW5 CCDC113-206ENST00000616795 891 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMIM10L2BP0DMW5 LINC00969-257ENST00000625632 898 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMIM10L2BP0DMW5 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMIM10L2BP0DMW5 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMIM10L2BP0DMW5 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMIM10L2BP0DMW5 TGOLN2-204ENST00000409015 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMIM10L2BP0DMW5 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMIM10L2BP0DMW5 CPN2-202ENST00000429275 2008 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMIM10L2BP0DMW5 FDFT1-214ENST00000528812 2013 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMIM10L2BP0DMW5 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMIM10L2BP0DMW5 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMIM10L2BP0DMW5 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMIM10L2BP0DMW5 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMIM10L2BP0DMW5 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMIM10L2BP0DMW5 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMIM10L2BP0DMW5 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMIM10L2BP0DMW5 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMIM10L2BP0DMW5 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMIM10L2BP0DMW5 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMIM10L2BP0DMW5 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMIM10L2BP0DMW5 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMIM10L2BP0DMW5 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMIM10L2BP0DMW5 ARL1-202ENST00000536227 1322 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMIM10L2BP0DMW5 ZDHHC8-201ENST00000320602 3072 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMIM10L2BP0DMW5 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMIM10L2BP0DMW5 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMIM10L2BP0DMW5 CCL19-201ENST00000311925 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMIM10L2BP0DMW5 NME4-203ENST00000397722 1232 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMIM10L2BP0DMW5 AC016757.1-202ENST00000409376 892 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMIM10L2BP0DMW5 SLC5A4-AS1-201ENST00000434942 876 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMIM10L2BP0DMW5 RPS23-207ENST00000511844 530 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMIM10L2BP0DMW5 LINC01485-202ENST00000520324 566 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMIM10L2BP0DMW5 AC091564.6-201ENST00000526633 487 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.9 ms