Protein–RNA interactions for Protein: P02776

PF4, Platelet factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PF4P02776 C15orf59-AS1-202ENST00000615095 1224 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
PF4P02776 AP003419.4-201ENST00000616071 517 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
PF4P02776 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
PF4P02776 MCC-201ENST00000302475 8257 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PF4P02776 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
PF4P02776 GRM1-204ENST00000492807 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PF4P02776 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PF4P02776 ARID3B-201ENST00000346246 4271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PF4P02776 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PF4P02776 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
PF4P02776 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
PF4P02776 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
PF4P02776 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
PF4P02776 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
PF4P02776 FREM3-201ENST00000329798 6729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
PF4P02776 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PF4P02776 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PF4P02776 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
PF4P02776 NAP1L6-201ENST00000373518 2044 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
PF4P02776 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
PF4P02776 AJAP1-202ENST00000378191 11666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PF4P02776 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PF4P02776 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
PF4P02776 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PF4P02776 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
PF4P02776 AWAT1-201ENST00000374521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PF4P02776 ZNF335-201ENST00000322927 4430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PF4P02776 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PF4P02776 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
PF4P02776 SLC46A1-207ENST00000612814 6376 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
PF4P02776 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
PF4P02776 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PF4P02776 ERC1-219ENST00000546231 4390 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
PF4P02776 PRDM15-207ENST00000447207 4928 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
PF4P02776 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PF4P02776 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
PF4P02776 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PF4P02776 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PF4P02776 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
PF4P02776 TMEM144-209ENST00000509278 1633 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PF4P02776 SUPT4H1-201ENST00000225504 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PF4P02776 RPRD1A-202ENST00000399022 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PF4P02776 AC245100.1-201ENST00000452996 1331 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PF4P02776 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PF4P02776 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PF4P02776 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
PF4P02776 TPM3-207ENST00000341372 2007 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
PF4P02776 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
PF4P02776 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
PF4P02776 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PF4P02776 STOX2-201ENST00000308497 10458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PF4P02776 DEF8-219ENST00000567874 1554 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
PF4P02776 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PF4P02776 MRGPRX4-201ENST00000314254 1444 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
PF4P02776 FP565260.6-203ENST00000620015 1435 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
PF4P02776 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
PF4P02776 AURKB-201ENST00000316199 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PF4P02776 NUDT1-201ENST00000339737 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PF4P02776 NUDT1-202ENST00000343985 771 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PF4P02776 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
PF4P02776 TNNT2-202ENST00000360372 969 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
PF4P02776 TNNT2-204ENST00000367317 1050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
PF4P02776 CELA2B-201ENST00000375910 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PF4P02776 Z69890.1-201ENST00000382990 339 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
PF4P02776 KRT18P36-201ENST00000411618 1276 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
PF4P02776 AC003075.1-208ENST00000415246 596 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
PF4P02776 TNNT2-209ENST00000421663 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PF4P02776 AC060234.1-201ENST00000422966 474 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
PF4P02776 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PF4P02776 AZGP1P1-202ENST00000425474 1181 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PF4P02776 AC114488.1-201ENST00000435872 591 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
PF4P02776 RPSAP15-201ENST00000448168 861 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
PF4P02776 AC104784.1-201ENST00000473096 294 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
PF4P02776 MAPK10-223ENST00000511167 1265 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
PF4P02776 ENDOV-229ENST00000523999 864 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PF4P02776 AC124068.2-202ENST00000562356 612 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
PF4P02776 AC124068.2-201ENST00000569473 1109 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
PF4P02776 PHBP15-201ENST00000574228 665 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
PF4P02776 ATRAID-207ENST00000606999 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PF4P02776 AL591471.1-201ENST00000621855 229 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
PF4P02776 MBD3L2B-201ENST00000636986 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PF4P02776 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
PF4P02776 SYNPO-205ENST00000522122 5098 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
PF4P02776 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
PF4P02776 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PF4P02776 LYRM9-202ENST00000379103 1685 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
PF4P02776 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
PF4P02776 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PF4P02776 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
PF4P02776 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PF4P02776 OCRL-201ENST00000357121 5138 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PF4P02776 LRRFIP1-202ENST00000289175 3709 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PF4P02776 TCL1A-203ENST00000554012 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PF4P02776 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
PF4P02776 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PF4P02776 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PF4P02776 GALNT7-201ENST00000265000 4307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PF4P02776 CACNB4-210ENST00000539935 8378 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PF4P02776 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
PF4P02776 DDX39A-201ENST00000242776 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.6 ms