Protein–RNA interactions for Protein: H3BUS1

SYS1-DBNDD2, SYS1-DBNDD2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC10.28□□□□□ -0.76
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
SYS1-DBNDD2H3BUS1 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LRRC8A-201ENST00000259324 4619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CEP78-205ENST00000424347 11198 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DIP2C-205ENST00000634311 4961 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AP001258.1-201ENST00000501817 2110 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RHD-209ENST00000568195 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PERP-201ENST00000421351 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZIC3-201ENST00000287538 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SCP2-203ENST00000371514 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
SYS1-DBNDD2H3BUS1 VPS52-218ENST00000482399 3338 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF773-205ENST00000599847 5832 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DLGAP1-202ENST00000400145 2188 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LDLRAD4-AS1-201ENST00000588672 2190 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MDGA1-207ENST00000505425 3021 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TP53I11-203ENST00000395648 3381 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LRFN5-201ENST00000298119 3723 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LIMS1-205ENST00000410093 1526 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
SYS1-DBNDD2H3BUS1 E2F3-203ENST00000613242 4094 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC5A10-201ENST00000317977 4436 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ETAA1-201ENST00000272342 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CSNK1G3-201ENST00000345990 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NTM-206ENST00000427481 2583 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
SYS1-DBNDD2H3BUS1 OR2A25-202ENST00000641441 1733 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.76
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC00523-206ENST00000556697 2071 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.76
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TOR1AIP1-212ENST00000606911 8704 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RUFY4-202ENST00000374155 2977 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.76
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TGOLN2-204ENST00000409015 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KLK2-202ENST00000358049 2847 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ARHGEF9-220ENST00000635729 1761 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FAM155A-201ENST00000375915 8503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 UBTF-206ENST00000527034 3010 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NLRP2-214ENST00000543010 3576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CELF3-202ENST00000290585 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC23A1-202ENST00000353963 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DIDO1-202ENST00000354665 2707 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C14orf159-219ENST00000521077 2719 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CATSPERZ-203ENST00000539943 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC10.27□□□□□ -0.77
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SYS1-DBNDD2H3BUS1 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DBF4B-202ENST00000393547 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DGCR5-203ENST00000438934 5492 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 IKZF1-206ENST00000359197 3487 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LHX6-204ENST00000394319 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CDC6-201ENST00000209728 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC009549.1-201ENST00000603468 1686 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CTAGE13P-201ENST00000416709 2446 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PDE12-201ENST00000311180 8773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PAX3-205ENST00000392069 3170 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TBC1D22A-203ENST00000380995 3934 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TRIM60-201ENST00000341062 1867 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FBXW11-201ENST00000265094 4342 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FANCC-202ENST00000375305 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ESR2-213ENST00000557772 5458 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SAP18-201ENST00000382533 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
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