Protein–RNA interactions for Protein: C9J2C7

NT5C1B-RDH14, NT5C1B-RDH14 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 533 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NT5C1B-RDH14C9J2C7 AP003390.1-201ENST00000533253 523 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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NT5C1B-RDH14C9J2C7 CMC2-204ENST00000562713 573 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NT5C1B-RDH14C9J2C7 CMC2-209ENST00000565108 399 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NT5C1B-RDH14C9J2C7 AC005357.2-202ENST00000590507 1060 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
NT5C1B-RDH14C9J2C7 AL118522.1-201ENST00000611368 560 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
NT5C1B-RDH14C9J2C7 MIR6074-201ENST00000612054 107 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
NT5C1B-RDH14C9J2C7 TP53-221ENST00000615910 1149 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NT5C1B-RDH14C9J2C7 POU2F2-204ENST00000526816 3218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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NT5C1B-RDH14C9J2C7 PLEKHB2-206ENST00000409612 2210 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NT5C1B-RDH14C9J2C7 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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NT5C1B-RDH14C9J2C7 CTBP2P8-201ENST00000422584 1330 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
NT5C1B-RDH14C9J2C7 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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NT5C1B-RDH14C9J2C7 CTNND2-202ENST00000458100 1962 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NT5C1B-RDH14C9J2C7 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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NT5C1B-RDH14C9J2C7 CDK11A-201ENST00000356200 2653 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NT5C1B-RDH14C9J2C7 IQCJ-201ENST00000397832 1460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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NT5C1B-RDH14C9J2C7 SIRT2-202ENST00000358931 1912 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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NT5C1B-RDH14C9J2C7 GULP1-204ENST00000409637 1242 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NT5C1B-RDH14C9J2C7 TRPM2-AS-201ENST00000423310 586 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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NT5C1B-RDH14C9J2C7 MMP7-201ENST00000260227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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NT5C1B-RDH14C9J2C7 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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