Protein–RNA interactions for Protein: A2IDD5

CCDC78, Coiled-coil domain-containing protein 78, humanhuman

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC78A2IDD5 MAGEA4-202ENST00000360243 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCDC78A2IDD5 MAGEA4-203ENST00000370335 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCDC78A2IDD5 MAGEA4-204ENST00000370340 1773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCDC78A2IDD5 CLN8-204ENST00000519254 1769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCDC78A2IDD5 TMBIM6-203ENST00000423828 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCDC78A2IDD5 PSKH1-201ENST00000291041 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCDC78A2IDD5 GPR88-201ENST00000315033 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCDC78A2IDD5 CSAD-203ENST00000379846 1962 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCDC78A2IDD5 PTK2-202ENST00000395218 4415 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCDC78A2IDD5 MLLT10-201ENST00000307729 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCDC78A2IDD5 UGT3A2-201ENST00000282507 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCDC78A2IDD5 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCDC78A2IDD5 ARMC5-205ENST00000563544 3549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCDC78A2IDD5 TINF2-215ENST00000626689 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCDC78A2IDD5 PRAME-214ENST00000543184 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCDC78A2IDD5 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCDC78A2IDD5 RAB15-201ENST00000267512 3391 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCDC78A2IDD5 LINC00479-201ENST00000412102 2033 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCDC78A2IDD5 B3GNT5-202ENST00000460419 3368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCDC78A2IDD5 FAM129B-202ENST00000373314 3760 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCDC78A2IDD5 PWWP2A-202ENST00000456329 3991 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCDC78A2IDD5 AC009133.1-201ENST00000569981 2449 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCDC78A2IDD5 SFI1-208ENST00000432498 4162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCDC78A2IDD5 HDAC7-209ENST00000427332 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCDC78A2IDD5 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCDC78A2IDD5 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCDC78A2IDD5 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCDC78A2IDD5 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCDC78A2IDD5 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCDC78A2IDD5 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCDC78A2IDD5 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CCDC78A2IDD5 AL645933.1-201ENST00000440087 609 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CCDC78A2IDD5 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CCDC78A2IDD5 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCDC78A2IDD5 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCDC78A2IDD5 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCDC78A2IDD5 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCDC78A2IDD5 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CCDC78A2IDD5 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCDC78A2IDD5 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CCDC78A2IDD5 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CCDC78A2IDD5 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCDC78A2IDD5 GAP43-201ENST00000305124 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCDC78A2IDD5 PRC1-204ENST00000442656 2060 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCDC78A2IDD5 ZDHHC8-201ENST00000320602 3072 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCDC78A2IDD5 SMARCA4-204ENST00000444061 4938 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCDC78A2IDD5 FAM189A1-201ENST00000261275 4705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCDC78A2IDD5 MYO16-203ENST00000357550 6779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCDC78A2IDD5 RNF167-201ENST00000262482 1915 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCDC78A2IDD5 SIGLECL1-208ENST00000614422 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCDC78A2IDD5 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCDC78A2IDD5 RGMA-204ENST00000543599 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCDC78A2IDD5 BEAN1-201ENST00000299694 2160 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCDC78A2IDD5 DIRAS3-201ENST00000370981 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCDC78A2IDD5 RCC1-201ENST00000373831 1577 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCDC78A2IDD5 PUF60-209ENST00000527197 1559 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCDC78A2IDD5 LINC00863-201ENST00000439559 3287 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCDC78A2IDD5 OR3A2-205ENST00000641164 2033 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCDC78A2IDD5 OAS3-201ENST00000228928 6719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCDC78A2IDD5 USP44-203ENST00000537435 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCDC78A2IDD5 UBE2I-204ENST00000397515 3109 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCDC78A2IDD5 JMJD6-208ENST00000617192 5517 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCDC78A2IDD5 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCDC78A2IDD5 ANKHD1-203ENST00000360839 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCDC78A2IDD5 AC012184.2-203ENST00000443119 2110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCDC78A2IDD5 ETV4-203ENST00000538265 2147 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCDC78A2IDD5 GLB1L-202ENST00000392089 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCDC78A2IDD5 GFPT2-201ENST00000253778 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCDC78A2IDD5 RREB1-210ENST00000611109 3563 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCDC78A2IDD5 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCDC78A2IDD5 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCDC78A2IDD5 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCDC78A2IDD5 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCDC78A2IDD5 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCDC78A2IDD5 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCDC78A2IDD5 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCDC78A2IDD5 AC012507.1-201ENST00000454890 600 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCDC78A2IDD5 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCDC78A2IDD5 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCDC78A2IDD5 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCDC78A2IDD5 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCDC78A2IDD5 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCDC78A2IDD5 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCDC78A2IDD5 AC005962.1-201ENST00000584100 773 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CCDC78A2IDD5 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCDC78A2IDD5 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCDC78A2IDD5 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CCDC78A2IDD5 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCDC78A2IDD5 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CCDC78A2IDD5 AKNA-204ENST00000374075 5038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCDC78A2IDD5 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCDC78A2IDD5 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCDC78A2IDD5 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCDC78A2IDD5 MED14-201ENST00000324817 7984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCDC78A2IDD5 PRIMPOL-211ENST00000515774 2007 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCDC78A2IDD5 TUBB8P4-201ENST00000511806 1324 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CCDC78A2IDD5 CHD1-212ENST00000614616 8095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCDC78A2IDD5 SATB2-211ENST00000614512 4972 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCDC78A2IDD5 TAPBP-234ENST00000434618 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCDC78A2IDD5 PCM1-202ENST00000327578 8287 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms