Protein–RNA interactions for Protein: A2A2Y4

FRMD3, FERM domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMD3A2A2Y4 PPP1R1B-203ENST00000394267 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FRMD3A2A2Y4 AOC1-201ENST00000360937 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FRMD3A2A2Y4 ARHGAP36-201ENST00000276211 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FRMD3A2A2Y4 LRP10-203ENST00000546834 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FRMD3A2A2Y4 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FRMD3A2A2Y4 SNX14-203ENST00000369627 3111 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FRMD3A2A2Y4 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FRMD3A2A2Y4 SCYL1-205ENST00000524944 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FRMD3A2A2Y4 PDE4A-209ENST00000592685 2707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FRMD3A2A2Y4 POLR3K-201ENST00000293860 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FRMD3A2A2Y4 ZFP64-203ENST00000361387 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FRMD3A2A2Y4 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FRMD3A2A2Y4 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FRMD3A2A2Y4 IL17RD-203ENST00000463523 2348 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FRMD3A2A2Y4 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FRMD3A2A2Y4 KCNC2-202ENST00000350228 3344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FRMD3A2A2Y4 HNRNPUL1-204ENST00000392006 3555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FRMD3A2A2Y4 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FRMD3A2A2Y4 LBH-201ENST00000395323 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FRMD3A2A2Y4 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FRMD3A2A2Y4 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FRMD3A2A2Y4 SEC13-208ENST00000397109 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FRMD3A2A2Y4 RAN-210ENST00000541630 1475 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FRMD3A2A2Y4 PRDM16-203ENST00000378391 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FRMD3A2A2Y4 EPS8L3-202ENST00000361965 1971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FRMD3A2A2Y4 CPNE2-204ENST00000565874 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FRMD3A2A2Y4 FRMD8-201ENST00000317568 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FRMD3A2A2Y4 MED4-201ENST00000258648 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FRMD3A2A2Y4 ACVR1C-204ENST00000409680 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FRMD3A2A2Y4 GABRB2-205ENST00000517901 1779 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FRMD3A2A2Y4 SSBP1-201ENST00000265304 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FRMD3A2A2Y4 RANBP1-201ENST00000331821 837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FRMD3A2A2Y4 FOLR1-202ENST00000393676 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FRMD3A2A2Y4 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FRMD3A2A2Y4 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FRMD3A2A2Y4 LINC00686-201ENST00000435412 332 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FRMD3A2A2Y4 HVCN1-203ENST00000439744 1215 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FRMD3A2A2Y4 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FRMD3A2A2Y4 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FRMD3A2A2Y4 AGTRAP-206ENST00000452018 809 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FRMD3A2A2Y4 CPLX2-209ENST00000515094 576 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FRMD3A2A2Y4 CCNC-217ENST00000523985 958 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FRMD3A2A2Y4 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FRMD3A2A2Y4 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FRMD3A2A2Y4 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
FRMD3A2A2Y4 AC008133.1-201ENST00000584688 557 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FRMD3A2A2Y4 PPP6R2-203ENST00000395741 3304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FRMD3A2A2Y4 KLHL13-207ENST00000540167 3396 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FRMD3A2A2Y4 DNAJC22-202ENST00000549441 4412 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FRMD3A2A2Y4 RARS2-201ENST00000369536 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FRMD3A2A2Y4 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FRMD3A2A2Y4 CCP110-203ENST00000396212 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FRMD3A2A2Y4 LOXL3-202ENST00000393937 2398 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FRMD3A2A2Y4 PITRM1-206ENST00000451104 3183 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FRMD3A2A2Y4 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FRMD3A2A2Y4 ADAMTS7P1-201ENST00000613213 4793 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
FRMD3A2A2Y4 AC099521.3-201ENST00000624251 2938 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
FRMD3A2A2Y4 PTPA-205ENST00000357197 2653 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FRMD3A2A2Y4 TUBGCP6-201ENST00000248846 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FRMD3A2A2Y4 INF2-209ENST00000617571 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FRMD3A2A2Y4 SOX21-AS1-201ENST00000438290 3287 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FRMD3A2A2Y4 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FRMD3A2A2Y4 HYOU1-219ENST00000614711 3057 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FRMD3A2A2Y4 ABAT-213ENST00000567812 1959 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FRMD3A2A2Y4 YIPF3-213ENST00000506469 1444 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FRMD3A2A2Y4 LINC01815-202ENST00000641468 1409 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
FRMD3A2A2Y4 SLC13A5-202ENST00000381074 1738 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FRMD3A2A2Y4 LIMD2-201ENST00000259006 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FRMD3A2A2Y4 PSEN2-202ENST00000366783 2306 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FRMD3A2A2Y4 MINDY1-207ENST00000622754 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FRMD3A2A2Y4 CHRNA3-201ENST00000326828 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FRMD3A2A2Y4 TRPV4-202ENST00000418703 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FRMD3A2A2Y4 TRIM10-204ENST00000449742 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FRMD3A2A2Y4 ZNF674-AS1-201ENST00000421685 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FRMD3A2A2Y4 TPO-205ENST00000382201 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FRMD3A2A2Y4 HDAC11-213ENST00000437379 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FRMD3A2A2Y4 RNF41-202ENST00000394013 2452 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FRMD3A2A2Y4 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FRMD3A2A2Y4 SYCP2L-201ENST00000283141 3130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FRMD3A2A2Y4 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FRMD3A2A2Y4 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FRMD3A2A2Y4 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
FRMD3A2A2Y4 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FRMD3A2A2Y4 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
FRMD3A2A2Y4 FKBP11-202ENST00000444214 630 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FRMD3A2A2Y4 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FRMD3A2A2Y4 AC125604.1-201ENST00000496255 707 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
FRMD3A2A2Y4 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FRMD3A2A2Y4 AC015689.1-201ENST00000525365 462 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FRMD3A2A2Y4 SYT17-208ENST00000568433 812 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FRMD3A2A2Y4 AC129507.4-201ENST00000570501 411 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FRMD3A2A2Y4 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FRMD3A2A2Y4 SELENOW-204ENST00000595615 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FRMD3A2A2Y4 SELENOW-216ENST00000612212 875 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FRMD3A2A2Y4 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FRMD3A2A2Y4 PAPSS2-202ENST00000456849 3856 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FRMD3A2A2Y4 SLCO6A1-207ENST00000513675 1611 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FRMD3A2A2Y4 PAX5-214ENST00000523241 1342 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FRMD3A2A2Y4 PLA2G3-201ENST00000215885 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FRMD3A2A2Y4 GAP43-201ENST00000305124 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.9 ms