Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5Y5

PEX16, Peroxisomal membrane protein PEX16, humanhuman

Predictions only

Length 336 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX16Q9Y5Y5 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PEX16Q9Y5Y5 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PEX16Q9Y5Y5 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PEX16Q9Y5Y5 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PEX16Q9Y5Y5 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PEX16Q9Y5Y5 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PEX16Q9Y5Y5 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PEX16Q9Y5Y5 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PEX16Q9Y5Y5 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PEX16Q9Y5Y5 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PEX16Q9Y5Y5 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PEX16Q9Y5Y5 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PEX16Q9Y5Y5 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PEX16Q9Y5Y5 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PEX16Q9Y5Y5 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PEX16Q9Y5Y5 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PEX16Q9Y5Y5 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PEX16Q9Y5Y5 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PEX16Q9Y5Y5 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PEX16Q9Y5Y5 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PEX16Q9Y5Y5 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PEX16Q9Y5Y5 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PEX16Q9Y5Y5 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PEX16Q9Y5Y5 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PEX16Q9Y5Y5 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PEX16Q9Y5Y5 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PEX16Q9Y5Y5 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PEX16Q9Y5Y5 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PEX16Q9Y5Y5 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PEX16Q9Y5Y5 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PEX16Q9Y5Y5 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PEX16Q9Y5Y5 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
PEX16Q9Y5Y5 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PEX16Q9Y5Y5 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
PEX16Q9Y5Y5 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PEX16Q9Y5Y5 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PEX16Q9Y5Y5 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PEX16Q9Y5Y5 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PEX16Q9Y5Y5 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PEX16Q9Y5Y5 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PEX16Q9Y5Y5 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PEX16Q9Y5Y5 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PEX16Q9Y5Y5 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PEX16Q9Y5Y5 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PEX16Q9Y5Y5 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PEX16Q9Y5Y5 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PEX16Q9Y5Y5 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
PEX16Q9Y5Y5 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PEX16Q9Y5Y5 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PEX16Q9Y5Y5 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PEX16Q9Y5Y5 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PEX16Q9Y5Y5 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PEX16Q9Y5Y5 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PEX16Q9Y5Y5 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PEX16Q9Y5Y5 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PEX16Q9Y5Y5 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PEX16Q9Y5Y5 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PEX16Q9Y5Y5 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PEX16Q9Y5Y5 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PEX16Q9Y5Y5 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PEX16Q9Y5Y5 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PEX16Q9Y5Y5 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PEX16Q9Y5Y5 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PEX16Q9Y5Y5 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PEX16Q9Y5Y5 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
PEX16Q9Y5Y5 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
PEX16Q9Y5Y5 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PEX16Q9Y5Y5 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PEX16Q9Y5Y5 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PEX16Q9Y5Y5 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PEX16Q9Y5Y5 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PEX16Q9Y5Y5 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PEX16Q9Y5Y5 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PEX16Q9Y5Y5 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PEX16Q9Y5Y5 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PEX16Q9Y5Y5 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PEX16Q9Y5Y5 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PEX16Q9Y5Y5 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PEX16Q9Y5Y5 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PEX16Q9Y5Y5 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
PEX16Q9Y5Y5 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
PEX16Q9Y5Y5 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PEX16Q9Y5Y5 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PEX16Q9Y5Y5 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
PEX16Q9Y5Y5 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
PEX16Q9Y5Y5 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PEX16Q9Y5Y5 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PEX16Q9Y5Y5 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PEX16Q9Y5Y5 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PEX16Q9Y5Y5 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PEX16Q9Y5Y5 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PEX16Q9Y5Y5 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PEX16Q9Y5Y5 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PEX16Q9Y5Y5 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PEX16Q9Y5Y5 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PEX16Q9Y5Y5 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PEX16Q9Y5Y5 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PEX16Q9Y5Y5 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PEX16Q9Y5Y5 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PEX16Q9Y5Y5 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.9 ms