Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5X2

SNX8, Sorting nexin-8, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX8Q9Y5X2 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SNX8Q9Y5X2 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SNX8Q9Y5X2 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SNX8Q9Y5X2 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SNX8Q9Y5X2 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SNX8Q9Y5X2 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SNX8Q9Y5X2 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SNX8Q9Y5X2 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SNX8Q9Y5X2 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SNX8Q9Y5X2 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SNX8Q9Y5X2 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SNX8Q9Y5X2 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SNX8Q9Y5X2 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SNX8Q9Y5X2 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SNX8Q9Y5X2 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SNX8Q9Y5X2 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SNX8Q9Y5X2 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SNX8Q9Y5X2 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SNX8Q9Y5X2 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SNX8Q9Y5X2 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SNX8Q9Y5X2 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SNX8Q9Y5X2 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SNX8Q9Y5X2 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SNX8Q9Y5X2 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SNX8Q9Y5X2 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SNX8Q9Y5X2 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SNX8Q9Y5X2 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SNX8Q9Y5X2 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SNX8Q9Y5X2 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SNX8Q9Y5X2 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SNX8Q9Y5X2 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SNX8Q9Y5X2 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SNX8Q9Y5X2 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SNX8Q9Y5X2 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SNX8Q9Y5X2 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SNX8Q9Y5X2 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SNX8Q9Y5X2 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SNX8Q9Y5X2 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SNX8Q9Y5X2 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SNX8Q9Y5X2 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SNX8Q9Y5X2 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SNX8Q9Y5X2 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SNX8Q9Y5X2 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SNX8Q9Y5X2 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SNX8Q9Y5X2 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SNX8Q9Y5X2 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SNX8Q9Y5X2 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SNX8Q9Y5X2 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SNX8Q9Y5X2 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SNX8Q9Y5X2 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SNX8Q9Y5X2 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SNX8Q9Y5X2 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SNX8Q9Y5X2 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SNX8Q9Y5X2 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SNX8Q9Y5X2 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SNX8Q9Y5X2 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SNX8Q9Y5X2 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
SNX8Q9Y5X2 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SNX8Q9Y5X2 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
SNX8Q9Y5X2 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SNX8Q9Y5X2 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SNX8Q9Y5X2 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SNX8Q9Y5X2 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1
SNX8Q9Y5X2 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SNX8Q9Y5X2 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SNX8Q9Y5X2 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SNX8Q9Y5X2 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SNX8Q9Y5X2 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SNX8Q9Y5X2 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SNX8Q9Y5X2 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SNX8Q9Y5X2 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SNX8Q9Y5X2 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SNX8Q9Y5X2 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SNX8Q9Y5X2 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SNX8Q9Y5X2 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SNX8Q9Y5X2 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SNX8Q9Y5X2 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SNX8Q9Y5X2 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SNX8Q9Y5X2 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SNX8Q9Y5X2 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SNX8Q9Y5X2 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SNX8Q9Y5X2 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SNX8Q9Y5X2 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SNX8Q9Y5X2 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SNX8Q9Y5X2 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
SNX8Q9Y5X2 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SNX8Q9Y5X2 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SNX8Q9Y5X2 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SNX8Q9Y5X2 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SNX8Q9Y5X2 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SNX8Q9Y5X2 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SNX8Q9Y5X2 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SNX8Q9Y5X2 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SNX8Q9Y5X2 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SNX8Q9Y5X2 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
SNX8Q9Y5X2 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
SNX8Q9Y5X2 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
SNX8Q9Y5X2 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SNX8Q9Y5X2 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SNX8Q9Y5X2 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms