Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5P3

RAI2, Retinoic acid-induced protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAI2Q9Y5P3 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RAI2Q9Y5P3 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RAI2Q9Y5P3 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RAI2Q9Y5P3 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
RAI2Q9Y5P3 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RAI2Q9Y5P3 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RAI2Q9Y5P3 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RAI2Q9Y5P3 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RAI2Q9Y5P3 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RAI2Q9Y5P3 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RAI2Q9Y5P3 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RAI2Q9Y5P3 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RAI2Q9Y5P3 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RAI2Q9Y5P3 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RAI2Q9Y5P3 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RAI2Q9Y5P3 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RAI2Q9Y5P3 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RAI2Q9Y5P3 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RAI2Q9Y5P3 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
RAI2Q9Y5P3 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
RAI2Q9Y5P3 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RAI2Q9Y5P3 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RAI2Q9Y5P3 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RAI2Q9Y5P3 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RAI2Q9Y5P3 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RAI2Q9Y5P3 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RAI2Q9Y5P3 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RAI2Q9Y5P3 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RAI2Q9Y5P3 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RAI2Q9Y5P3 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.24
RAI2Q9Y5P3 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
RAI2Q9Y5P3 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAI2Q9Y5P3 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAI2Q9Y5P3 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAI2Q9Y5P3 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAI2Q9Y5P3 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAI2Q9Y5P3 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAI2Q9Y5P3 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAI2Q9Y5P3 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RAI2Q9Y5P3 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RAI2Q9Y5P3 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RAI2Q9Y5P3 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RAI2Q9Y5P3 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RAI2Q9Y5P3 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RAI2Q9Y5P3 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RAI2Q9Y5P3 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RAI2Q9Y5P3 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RAI2Q9Y5P3 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RAI2Q9Y5P3 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RAI2Q9Y5P3 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RAI2Q9Y5P3 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RAI2Q9Y5P3 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RAI2Q9Y5P3 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RAI2Q9Y5P3 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RAI2Q9Y5P3 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RAI2Q9Y5P3 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RAI2Q9Y5P3 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RAI2Q9Y5P3 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RAI2Q9Y5P3 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RAI2Q9Y5P3 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RAI2Q9Y5P3 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RAI2Q9Y5P3 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RAI2Q9Y5P3 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RAI2Q9Y5P3 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
RAI2Q9Y5P3 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RAI2Q9Y5P3 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RAI2Q9Y5P3 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RAI2Q9Y5P3 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RAI2Q9Y5P3 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RAI2Q9Y5P3 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RAI2Q9Y5P3 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RAI2Q9Y5P3 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
RAI2Q9Y5P3 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RAI2Q9Y5P3 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RAI2Q9Y5P3 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RAI2Q9Y5P3 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RAI2Q9Y5P3 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RAI2Q9Y5P3 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RAI2Q9Y5P3 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RAI2Q9Y5P3 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAI2Q9Y5P3 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAI2Q9Y5P3 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAI2Q9Y5P3 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAI2Q9Y5P3 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAI2Q9Y5P3 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAI2Q9Y5P3 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAI2Q9Y5P3 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAI2Q9Y5P3 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAI2Q9Y5P3 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAI2Q9Y5P3 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAI2Q9Y5P3 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAI2Q9Y5P3 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAI2Q9Y5P3 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAI2Q9Y5P3 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAI2Q9Y5P3 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAI2Q9Y5P3 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAI2Q9Y5P3 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RAI2Q9Y5P3 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RAI2Q9Y5P3 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RAI2Q9Y5P3 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms