Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y535

POLR3H, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR3HQ9Y535 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
POLR3HQ9Y535 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
POLR3HQ9Y535 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
POLR3HQ9Y535 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
POLR3HQ9Y535 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
POLR3HQ9Y535 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
POLR3HQ9Y535 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
POLR3HQ9Y535 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
POLR3HQ9Y535 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
POLR3HQ9Y535 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
POLR3HQ9Y535 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
POLR3HQ9Y535 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
POLR3HQ9Y535 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
POLR3HQ9Y535 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
POLR3HQ9Y535 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
POLR3HQ9Y535 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
POLR3HQ9Y535 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
POLR3HQ9Y535 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
POLR3HQ9Y535 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
POLR3HQ9Y535 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
POLR3HQ9Y535 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
POLR3HQ9Y535 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
POLR3HQ9Y535 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
POLR3HQ9Y535 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
POLR3HQ9Y535 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
POLR3HQ9Y535 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
POLR3HQ9Y535 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
POLR3HQ9Y535 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
POLR3HQ9Y535 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
POLR3HQ9Y535 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
POLR3HQ9Y535 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
POLR3HQ9Y535 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
POLR3HQ9Y535 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
POLR3HQ9Y535 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
POLR3HQ9Y535 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
POLR3HQ9Y535 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
POLR3HQ9Y535 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
POLR3HQ9Y535 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
POLR3HQ9Y535 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
POLR3HQ9Y535 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
POLR3HQ9Y535 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
POLR3HQ9Y535 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
POLR3HQ9Y535 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
POLR3HQ9Y535 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
POLR3HQ9Y535 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
POLR3HQ9Y535 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
POLR3HQ9Y535 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
POLR3HQ9Y535 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
POLR3HQ9Y535 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
POLR3HQ9Y535 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
POLR3HQ9Y535 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
POLR3HQ9Y535 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
POLR3HQ9Y535 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
POLR3HQ9Y535 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
POLR3HQ9Y535 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
POLR3HQ9Y535 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
POLR3HQ9Y535 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
POLR3HQ9Y535 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
POLR3HQ9Y535 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
POLR3HQ9Y535 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
POLR3HQ9Y535 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
POLR3HQ9Y535 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
POLR3HQ9Y535 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
POLR3HQ9Y535 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
POLR3HQ9Y535 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
POLR3HQ9Y535 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
POLR3HQ9Y535 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
POLR3HQ9Y535 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
POLR3HQ9Y535 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
POLR3HQ9Y535 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
POLR3HQ9Y535 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
POLR3HQ9Y535 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
POLR3HQ9Y535 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
POLR3HQ9Y535 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
POLR3HQ9Y535 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
POLR3HQ9Y535 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
POLR3HQ9Y535 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
POLR3HQ9Y535 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
POLR3HQ9Y535 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
POLR3HQ9Y535 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
POLR3HQ9Y535 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
POLR3HQ9Y535 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
POLR3HQ9Y535 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
POLR3HQ9Y535 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
POLR3HQ9Y535 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
POLR3HQ9Y535 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
POLR3HQ9Y535 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
POLR3HQ9Y535 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
POLR3HQ9Y535 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
POLR3HQ9Y535 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
POLR3HQ9Y535 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
POLR3HQ9Y535 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
POLR3HQ9Y535 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
POLR3HQ9Y535 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
POLR3HQ9Y535 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
POLR3HQ9Y535 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
POLR3HQ9Y535 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
POLR3HQ9Y535 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
POLR3HQ9Y535 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
POLR3HQ9Y535 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms