Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3P8

SIT1, Signaling threshold-regulating transmembrane adapter 1, humanhuman

Predictions only

Length 196 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIT1Q9Y3P8 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SIT1Q9Y3P8 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SIT1Q9Y3P8 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SIT1Q9Y3P8 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SIT1Q9Y3P8 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SIT1Q9Y3P8 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SIT1Q9Y3P8 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SIT1Q9Y3P8 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SIT1Q9Y3P8 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SIT1Q9Y3P8 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SIT1Q9Y3P8 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SIT1Q9Y3P8 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SIT1Q9Y3P8 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SIT1Q9Y3P8 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SIT1Q9Y3P8 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SIT1Q9Y3P8 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SIT1Q9Y3P8 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SIT1Q9Y3P8 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SIT1Q9Y3P8 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SIT1Q9Y3P8 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SIT1Q9Y3P8 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SIT1Q9Y3P8 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SIT1Q9Y3P8 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SIT1Q9Y3P8 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SIT1Q9Y3P8 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SIT1Q9Y3P8 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SIT1Q9Y3P8 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SIT1Q9Y3P8 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SIT1Q9Y3P8 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SIT1Q9Y3P8 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SIT1Q9Y3P8 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SIT1Q9Y3P8 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SIT1Q9Y3P8 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SIT1Q9Y3P8 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SIT1Q9Y3P8 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SIT1Q9Y3P8 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SIT1Q9Y3P8 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SIT1Q9Y3P8 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SIT1Q9Y3P8 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SIT1Q9Y3P8 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SIT1Q9Y3P8 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SIT1Q9Y3P8 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SIT1Q9Y3P8 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SIT1Q9Y3P8 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SIT1Q9Y3P8 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SIT1Q9Y3P8 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SIT1Q9Y3P8 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SIT1Q9Y3P8 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SIT1Q9Y3P8 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SIT1Q9Y3P8 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SIT1Q9Y3P8 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SIT1Q9Y3P8 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SIT1Q9Y3P8 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SIT1Q9Y3P8 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SIT1Q9Y3P8 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SIT1Q9Y3P8 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SIT1Q9Y3P8 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SIT1Q9Y3P8 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SIT1Q9Y3P8 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SIT1Q9Y3P8 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SIT1Q9Y3P8 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SIT1Q9Y3P8 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SIT1Q9Y3P8 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SIT1Q9Y3P8 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SIT1Q9Y3P8 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SIT1Q9Y3P8 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SIT1Q9Y3P8 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SIT1Q9Y3P8 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SIT1Q9Y3P8 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SIT1Q9Y3P8 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SIT1Q9Y3P8 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SIT1Q9Y3P8 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SIT1Q9Y3P8 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SIT1Q9Y3P8 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SIT1Q9Y3P8 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SIT1Q9Y3P8 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SIT1Q9Y3P8 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
SIT1Q9Y3P8 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SIT1Q9Y3P8 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SIT1Q9Y3P8 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SIT1Q9Y3P8 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SIT1Q9Y3P8 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SIT1Q9Y3P8 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SIT1Q9Y3P8 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SIT1Q9Y3P8 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SIT1Q9Y3P8 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SIT1Q9Y3P8 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SIT1Q9Y3P8 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SIT1Q9Y3P8 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SIT1Q9Y3P8 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SIT1Q9Y3P8 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SIT1Q9Y3P8 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SIT1Q9Y3P8 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SIT1Q9Y3P8 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SIT1Q9Y3P8 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SIT1Q9Y3P8 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SIT1Q9Y3P8 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SIT1Q9Y3P8 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SIT1Q9Y3P8 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
SIT1Q9Y3P8 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms