Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3B3

TMED7, Transmembrane emp24 domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMED7Q9Y3B3 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
TMED7Q9Y3B3 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TMED7Q9Y3B3 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TMED7Q9Y3B3 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TMED7Q9Y3B3 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TMED7Q9Y3B3 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMED7Q9Y3B3 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMED7Q9Y3B3 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMED7Q9Y3B3 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMED7Q9Y3B3 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMED7Q9Y3B3 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMED7Q9Y3B3 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMED7Q9Y3B3 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMED7Q9Y3B3 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMED7Q9Y3B3 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMED7Q9Y3B3 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMED7Q9Y3B3 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMED7Q9Y3B3 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMED7Q9Y3B3 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMED7Q9Y3B3 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMED7Q9Y3B3 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMED7Q9Y3B3 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMED7Q9Y3B3 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMED7Q9Y3B3 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMED7Q9Y3B3 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMED7Q9Y3B3 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMED7Q9Y3B3 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
TMED7Q9Y3B3 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMED7Q9Y3B3 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMED7Q9Y3B3 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMED7Q9Y3B3 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMED7Q9Y3B3 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMED7Q9Y3B3 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TMED7Q9Y3B3 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
TMED7Q9Y3B3 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TMED7Q9Y3B3 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TMED7Q9Y3B3 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TMED7Q9Y3B3 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TMED7Q9Y3B3 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TMED7Q9Y3B3 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TMED7Q9Y3B3 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TMED7Q9Y3B3 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TMED7Q9Y3B3 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TMED7Q9Y3B3 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TMED7Q9Y3B3 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
TMED7Q9Y3B3 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.87
TMED7Q9Y3B3 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TMED7Q9Y3B3 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TMED7Q9Y3B3 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TMED7Q9Y3B3 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TMED7Q9Y3B3 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TMED7Q9Y3B3 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TMED7Q9Y3B3 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TMED7Q9Y3B3 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TMED7Q9Y3B3 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TMED7Q9Y3B3 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TMED7Q9Y3B3 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TMED7Q9Y3B3 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TMED7Q9Y3B3 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TMED7Q9Y3B3 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TMED7Q9Y3B3 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TMED7Q9Y3B3 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TMED7Q9Y3B3 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TMED7Q9Y3B3 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TMED7Q9Y3B3 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TMED7Q9Y3B3 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TMED7Q9Y3B3 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TMED7Q9Y3B3 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TMED7Q9Y3B3 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TMED7Q9Y3B3 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TMED7Q9Y3B3 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
TMED7Q9Y3B3 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TMED7Q9Y3B3 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TMED7Q9Y3B3 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TMED7Q9Y3B3 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TMED7Q9Y3B3 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
TMED7Q9Y3B3 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TMED7Q9Y3B3 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TMED7Q9Y3B3 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TMED7Q9Y3B3 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TMED7Q9Y3B3 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TMED7Q9Y3B3 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TMED7Q9Y3B3 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TMED7Q9Y3B3 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TMED7Q9Y3B3 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TMED7Q9Y3B3 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TMED7Q9Y3B3 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TMED7Q9Y3B3 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TMED7Q9Y3B3 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TMED7Q9Y3B3 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TMED7Q9Y3B3 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TMED7Q9Y3B3 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TMED7Q9Y3B3 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TMED7Q9Y3B3 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TMED7Q9Y3B3 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TMED7Q9Y3B3 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
TMED7Q9Y3B3 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TMED7Q9Y3B3 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TMED7Q9Y3B3 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
TMED7Q9Y3B3 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms