Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y315

DERA, Deoxyribose-phosphate aldolase, humanhuman

Predictions only

Length 318 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DERAQ9Y315 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
DERAQ9Y315 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
DERAQ9Y315 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
DERAQ9Y315 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.48
DERAQ9Y315 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
DERAQ9Y315 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
DERAQ9Y315 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
DERAQ9Y315 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
DERAQ9Y315 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
DERAQ9Y315 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
DERAQ9Y315 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
DERAQ9Y315 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
DERAQ9Y315 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
DERAQ9Y315 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
DERAQ9Y315 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
DERAQ9Y315 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
DERAQ9Y315 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
DERAQ9Y315 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
DERAQ9Y315 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
DERAQ9Y315 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
DERAQ9Y315 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
DERAQ9Y315 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
DERAQ9Y315 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
DERAQ9Y315 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
DERAQ9Y315 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
DERAQ9Y315 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
DERAQ9Y315 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
DERAQ9Y315 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
DERAQ9Y315 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
DERAQ9Y315 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
DERAQ9Y315 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
DERAQ9Y315 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
DERAQ9Y315 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
DERAQ9Y315 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
DERAQ9Y315 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
DERAQ9Y315 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
DERAQ9Y315 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
DERAQ9Y315 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
DERAQ9Y315 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
DERAQ9Y315 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
DERAQ9Y315 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
DERAQ9Y315 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
DERAQ9Y315 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
DERAQ9Y315 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
DERAQ9Y315 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
DERAQ9Y315 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
DERAQ9Y315 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
DERAQ9Y315 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
DERAQ9Y315 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
DERAQ9Y315 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
DERAQ9Y315 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
DERAQ9Y315 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
DERAQ9Y315 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
DERAQ9Y315 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
DERAQ9Y315 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
DERAQ9Y315 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
DERAQ9Y315 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
DERAQ9Y315 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
DERAQ9Y315 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
DERAQ9Y315 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
DERAQ9Y315 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
DERAQ9Y315 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
DERAQ9Y315 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
DERAQ9Y315 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
DERAQ9Y315 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
DERAQ9Y315 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
DERAQ9Y315 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
DERAQ9Y315 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
DERAQ9Y315 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
DERAQ9Y315 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
DERAQ9Y315 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
DERAQ9Y315 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
DERAQ9Y315 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
DERAQ9Y315 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
DERAQ9Y315 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
DERAQ9Y315 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
DERAQ9Y315 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
DERAQ9Y315 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
DERAQ9Y315 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
DERAQ9Y315 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
DERAQ9Y315 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
DERAQ9Y315 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
DERAQ9Y315 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
DERAQ9Y315 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
DERAQ9Y315 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
DERAQ9Y315 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
DERAQ9Y315 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
DERAQ9Y315 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
DERAQ9Y315 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
DERAQ9Y315 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
DERAQ9Y315 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
DERAQ9Y315 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
DERAQ9Y315 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
DERAQ9Y315 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
DERAQ9Y315 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
DERAQ9Y315 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
DERAQ9Y315 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
DERAQ9Y315 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
DERAQ9Y315 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
DERAQ9Y315 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms