Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2N7

HIF3A, Hypoxia-inducible factor 3-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIF3AQ9Y2N7 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HIF3AQ9Y2N7 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HIF3AQ9Y2N7 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HIF3AQ9Y2N7 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HIF3AQ9Y2N7 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HIF3AQ9Y2N7 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HIF3AQ9Y2N7 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HIF3AQ9Y2N7 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HIF3AQ9Y2N7 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HIF3AQ9Y2N7 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HIF3AQ9Y2N7 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HIF3AQ9Y2N7 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HIF3AQ9Y2N7 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HIF3AQ9Y2N7 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HIF3AQ9Y2N7 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HIF3AQ9Y2N7 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HIF3AQ9Y2N7 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HIF3AQ9Y2N7 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
HIF3AQ9Y2N7 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HIF3AQ9Y2N7 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HIF3AQ9Y2N7 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HIF3AQ9Y2N7 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HIF3AQ9Y2N7 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HIF3AQ9Y2N7 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HIF3AQ9Y2N7 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HIF3AQ9Y2N7 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HIF3AQ9Y2N7 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HIF3AQ9Y2N7 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HIF3AQ9Y2N7 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HIF3AQ9Y2N7 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HIF3AQ9Y2N7 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HIF3AQ9Y2N7 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HIF3AQ9Y2N7 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
HIF3AQ9Y2N7 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
HIF3AQ9Y2N7 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
HIF3AQ9Y2N7 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
HIF3AQ9Y2N7 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
HIF3AQ9Y2N7 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
HIF3AQ9Y2N7 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
HIF3AQ9Y2N7 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
HIF3AQ9Y2N7 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
HIF3AQ9Y2N7 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
HIF3AQ9Y2N7 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
HIF3AQ9Y2N7 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
HIF3AQ9Y2N7 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HIF3AQ9Y2N7 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
HIF3AQ9Y2N7 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HIF3AQ9Y2N7 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HIF3AQ9Y2N7 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HIF3AQ9Y2N7 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
HIF3AQ9Y2N7 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
HIF3AQ9Y2N7 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HIF3AQ9Y2N7 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HIF3AQ9Y2N7 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
HIF3AQ9Y2N7 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HIF3AQ9Y2N7 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
HIF3AQ9Y2N7 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HIF3AQ9Y2N7 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HIF3AQ9Y2N7 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HIF3AQ9Y2N7 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
HIF3AQ9Y2N7 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HIF3AQ9Y2N7 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HIF3AQ9Y2N7 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HIF3AQ9Y2N7 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HIF3AQ9Y2N7 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HIF3AQ9Y2N7 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HIF3AQ9Y2N7 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HIF3AQ9Y2N7 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HIF3AQ9Y2N7 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HIF3AQ9Y2N7 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HIF3AQ9Y2N7 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
HIF3AQ9Y2N7 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
HIF3AQ9Y2N7 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HIF3AQ9Y2N7 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
HIF3AQ9Y2N7 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
HIF3AQ9Y2N7 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
HIF3AQ9Y2N7 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
HIF3AQ9Y2N7 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
HIF3AQ9Y2N7 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HIF3AQ9Y2N7 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
HIF3AQ9Y2N7 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
HIF3AQ9Y2N7 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
HIF3AQ9Y2N7 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HIF3AQ9Y2N7 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
HIF3AQ9Y2N7 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HIF3AQ9Y2N7 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HIF3AQ9Y2N7 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
HIF3AQ9Y2N7 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
HIF3AQ9Y2N7 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
HIF3AQ9Y2N7 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
HIF3AQ9Y2N7 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
HIF3AQ9Y2N7 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
HIF3AQ9Y2N7 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
HIF3AQ9Y2N7 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
HIF3AQ9Y2N7 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
HIF3AQ9Y2N7 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
HIF3AQ9Y2N7 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
HIF3AQ9Y2N7 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
HIF3AQ9Y2N7 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
HIF3AQ9Y2N7 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms