Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2D1

ATF5, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF5Q9Y2D1 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
ATF5Q9Y2D1 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
ATF5Q9Y2D1 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
ATF5Q9Y2D1 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
ATF5Q9Y2D1 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
ATF5Q9Y2D1 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
ATF5Q9Y2D1 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
ATF5Q9Y2D1 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
ATF5Q9Y2D1 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
ATF5Q9Y2D1 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
ATF5Q9Y2D1 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
ATF5Q9Y2D1 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
ATF5Q9Y2D1 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
ATF5Q9Y2D1 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
ATF5Q9Y2D1 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
ATF5Q9Y2D1 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
ATF5Q9Y2D1 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
ATF5Q9Y2D1 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
ATF5Q9Y2D1 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
ATF5Q9Y2D1 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
ATF5Q9Y2D1 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
ATF5Q9Y2D1 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
ATF5Q9Y2D1 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
ATF5Q9Y2D1 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC28.8■■■□□ 2.2
ATF5Q9Y2D1 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
ATF5Q9Y2D1 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
ATF5Q9Y2D1 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
ATF5Q9Y2D1 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
ATF5Q9Y2D1 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
ATF5Q9Y2D1 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
ATF5Q9Y2D1 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
ATF5Q9Y2D1 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
ATF5Q9Y2D1 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
ATF5Q9Y2D1 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
ATF5Q9Y2D1 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
ATF5Q9Y2D1 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
ATF5Q9Y2D1 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
ATF5Q9Y2D1 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
ATF5Q9Y2D1 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
ATF5Q9Y2D1 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC28.78■■■□□ 2.2
ATF5Q9Y2D1 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
ATF5Q9Y2D1 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
ATF5Q9Y2D1 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
ATF5Q9Y2D1 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
ATF5Q9Y2D1 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
ATF5Q9Y2D1 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
ATF5Q9Y2D1 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
ATF5Q9Y2D1 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
ATF5Q9Y2D1 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
ATF5Q9Y2D1 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
ATF5Q9Y2D1 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC28.76■■■□□ 2.19
ATF5Q9Y2D1 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
ATF5Q9Y2D1 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
ATF5Q9Y2D1 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
ATF5Q9Y2D1 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
ATF5Q9Y2D1 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
ATF5Q9Y2D1 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
ATF5Q9Y2D1 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
ATF5Q9Y2D1 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
ATF5Q9Y2D1 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
ATF5Q9Y2D1 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
ATF5Q9Y2D1 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
ATF5Q9Y2D1 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
ATF5Q9Y2D1 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
ATF5Q9Y2D1 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
ATF5Q9Y2D1 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
ATF5Q9Y2D1 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
ATF5Q9Y2D1 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
ATF5Q9Y2D1 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
ATF5Q9Y2D1 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
ATF5Q9Y2D1 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
ATF5Q9Y2D1 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
ATF5Q9Y2D1 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
ATF5Q9Y2D1 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
ATF5Q9Y2D1 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
ATF5Q9Y2D1 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
ATF5Q9Y2D1 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
ATF5Q9Y2D1 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
ATF5Q9Y2D1 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
ATF5Q9Y2D1 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
ATF5Q9Y2D1 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
ATF5Q9Y2D1 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
ATF5Q9Y2D1 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
ATF5Q9Y2D1 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
ATF5Q9Y2D1 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
ATF5Q9Y2D1 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
ATF5Q9Y2D1 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
ATF5Q9Y2D1 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
ATF5Q9Y2D1 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
ATF5Q9Y2D1 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
ATF5Q9Y2D1 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
ATF5Q9Y2D1 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
ATF5Q9Y2D1 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
ATF5Q9Y2D1 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
ATF5Q9Y2D1 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
ATF5Q9Y2D1 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
ATF5Q9Y2D1 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
ATF5Q9Y2D1 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
ATF5Q9Y2D1 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
ATF5Q9Y2D1 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms