Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y244

POMP, Proteasome maturation protein, humanhuman

Predictions only

Length 141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POMPQ9Y244 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
POMPQ9Y244 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
POMPQ9Y244 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
POMPQ9Y244 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
POMPQ9Y244 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
POMPQ9Y244 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
POMPQ9Y244 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
POMPQ9Y244 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
POMPQ9Y244 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
POMPQ9Y244 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
POMPQ9Y244 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
POMPQ9Y244 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
POMPQ9Y244 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
POMPQ9Y244 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
POMPQ9Y244 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
POMPQ9Y244 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
POMPQ9Y244 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
POMPQ9Y244 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
POMPQ9Y244 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
POMPQ9Y244 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
POMPQ9Y244 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
POMPQ9Y244 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
POMPQ9Y244 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
POMPQ9Y244 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
POMPQ9Y244 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
POMPQ9Y244 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
POMPQ9Y244 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
POMPQ9Y244 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
POMPQ9Y244 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
POMPQ9Y244 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
POMPQ9Y244 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
POMPQ9Y244 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
POMPQ9Y244 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
POMPQ9Y244 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
POMPQ9Y244 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
POMPQ9Y244 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
POMPQ9Y244 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
POMPQ9Y244 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
POMPQ9Y244 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
POMPQ9Y244 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
POMPQ9Y244 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
POMPQ9Y244 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
POMPQ9Y244 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
POMPQ9Y244 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
POMPQ9Y244 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
POMPQ9Y244 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
POMPQ9Y244 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
POMPQ9Y244 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
POMPQ9Y244 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
POMPQ9Y244 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
POMPQ9Y244 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
POMPQ9Y244 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
POMPQ9Y244 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
POMPQ9Y244 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
POMPQ9Y244 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
POMPQ9Y244 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
POMPQ9Y244 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
POMPQ9Y244 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
POMPQ9Y244 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
POMPQ9Y244 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
POMPQ9Y244 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC21.45■■□□□ 1.03
POMPQ9Y244 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
POMPQ9Y244 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
POMPQ9Y244 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
POMPQ9Y244 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
POMPQ9Y244 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
POMPQ9Y244 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
POMPQ9Y244 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
POMPQ9Y244 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
POMPQ9Y244 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
POMPQ9Y244 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
POMPQ9Y244 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
POMPQ9Y244 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
POMPQ9Y244 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
POMPQ9Y244 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
POMPQ9Y244 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
POMPQ9Y244 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
POMPQ9Y244 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
POMPQ9Y244 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
POMPQ9Y244 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
POMPQ9Y244 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
POMPQ9Y244 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
POMPQ9Y244 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
POMPQ9Y244 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
POMPQ9Y244 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
POMPQ9Y244 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
POMPQ9Y244 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
POMPQ9Y244 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
POMPQ9Y244 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
POMPQ9Y244 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
POMPQ9Y244 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
POMPQ9Y244 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
POMPQ9Y244 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
POMPQ9Y244 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
POMPQ9Y244 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
POMPQ9Y244 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
POMPQ9Y244 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
POMPQ9Y244 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
POMPQ9Y244 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
POMPQ9Y244 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms