Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQP3

TNN, Tenascin-N, humanhuman

Predictions only

Length 1,299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNQ9UQP3 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
TNNQ9UQP3 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
TNNQ9UQP3 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
TNNQ9UQP3 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
TNNQ9UQP3 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
TNNQ9UQP3 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
TNNQ9UQP3 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
TNNQ9UQP3 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
TNNQ9UQP3 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
TNNQ9UQP3 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
TNNQ9UQP3 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
TNNQ9UQP3 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
TNNQ9UQP3 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
TNNQ9UQP3 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
TNNQ9UQP3 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
TNNQ9UQP3 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
TNNQ9UQP3 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
TNNQ9UQP3 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
TNNQ9UQP3 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
TNNQ9UQP3 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC28.84■■■□□ 2.21
TNNQ9UQP3 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
TNNQ9UQP3 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
TNNQ9UQP3 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
TNNQ9UQP3 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
TNNQ9UQP3 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
TNNQ9UQP3 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
TNNQ9UQP3 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
TNNQ9UQP3 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
TNNQ9UQP3 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
TNNQ9UQP3 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
TNNQ9UQP3 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
TNNQ9UQP3 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
TNNQ9UQP3 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
TNNQ9UQP3 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
TNNQ9UQP3 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
TNNQ9UQP3 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
TNNQ9UQP3 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
TNNQ9UQP3 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
TNNQ9UQP3 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
TNNQ9UQP3 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
TNNQ9UQP3 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
TNNQ9UQP3 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
TNNQ9UQP3 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
TNNQ9UQP3 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
TNNQ9UQP3 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
TNNQ9UQP3 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
TNNQ9UQP3 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
TNNQ9UQP3 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
TNNQ9UQP3 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
TNNQ9UQP3 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
TNNQ9UQP3 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
TNNQ9UQP3 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
TNNQ9UQP3 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
TNNQ9UQP3 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
TNNQ9UQP3 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
TNNQ9UQP3 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
TNNQ9UQP3 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
TNNQ9UQP3 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
TNNQ9UQP3 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
TNNQ9UQP3 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
TNNQ9UQP3 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
TNNQ9UQP3 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
TNNQ9UQP3 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
TNNQ9UQP3 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
TNNQ9UQP3 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
TNNQ9UQP3 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
TNNQ9UQP3 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
TNNQ9UQP3 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
TNNQ9UQP3 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
TNNQ9UQP3 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
TNNQ9UQP3 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
TNNQ9UQP3 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
TNNQ9UQP3 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
TNNQ9UQP3 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
TNNQ9UQP3 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
TNNQ9UQP3 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
TNNQ9UQP3 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
TNNQ9UQP3 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
TNNQ9UQP3 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
TNNQ9UQP3 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
TNNQ9UQP3 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
TNNQ9UQP3 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
TNNQ9UQP3 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
TNNQ9UQP3 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC28.76■■■□□ 2.19
TNNQ9UQP3 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
TNNQ9UQP3 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
TNNQ9UQP3 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
TNNQ9UQP3 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
TNNQ9UQP3 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
TNNQ9UQP3 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
TNNQ9UQP3 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
TNNQ9UQP3 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
TNNQ9UQP3 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
TNNQ9UQP3 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
TNNQ9UQP3 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
TNNQ9UQP3 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
TNNQ9UQP3 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
TNNQ9UQP3 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
TNNQ9UQP3 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
TNNQ9UQP3 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms