Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQ52

CNTN6, Contactin-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN6Q9UQ52 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CNTN6Q9UQ52 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CNTN6Q9UQ52 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CNTN6Q9UQ52 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CNTN6Q9UQ52 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CNTN6Q9UQ52 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CNTN6Q9UQ52 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CNTN6Q9UQ52 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CNTN6Q9UQ52 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CNTN6Q9UQ52 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CNTN6Q9UQ52 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CNTN6Q9UQ52 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CNTN6Q9UQ52 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CNTN6Q9UQ52 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CNTN6Q9UQ52 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CNTN6Q9UQ52 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CNTN6Q9UQ52 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CNTN6Q9UQ52 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CNTN6Q9UQ52 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CNTN6Q9UQ52 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
CNTN6Q9UQ52 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CNTN6Q9UQ52 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CNTN6Q9UQ52 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CNTN6Q9UQ52 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CNTN6Q9UQ52 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CNTN6Q9UQ52 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CNTN6Q9UQ52 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CNTN6Q9UQ52 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CNTN6Q9UQ52 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CNTN6Q9UQ52 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CNTN6Q9UQ52 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CNTN6Q9UQ52 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CNTN6Q9UQ52 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CNTN6Q9UQ52 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CNTN6Q9UQ52 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CNTN6Q9UQ52 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CNTN6Q9UQ52 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CNTN6Q9UQ52 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CNTN6Q9UQ52 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CNTN6Q9UQ52 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CNTN6Q9UQ52 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CNTN6Q9UQ52 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CNTN6Q9UQ52 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CNTN6Q9UQ52 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CNTN6Q9UQ52 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CNTN6Q9UQ52 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CNTN6Q9UQ52 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CNTN6Q9UQ52 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CNTN6Q9UQ52 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CNTN6Q9UQ52 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CNTN6Q9UQ52 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CNTN6Q9UQ52 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CNTN6Q9UQ52 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CNTN6Q9UQ52 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CNTN6Q9UQ52 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CNTN6Q9UQ52 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CNTN6Q9UQ52 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CNTN6Q9UQ52 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CNTN6Q9UQ52 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CNTN6Q9UQ52 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CNTN6Q9UQ52 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CNTN6Q9UQ52 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CNTN6Q9UQ52 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CNTN6Q9UQ52 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CNTN6Q9UQ52 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CNTN6Q9UQ52 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CNTN6Q9UQ52 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CNTN6Q9UQ52 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CNTN6Q9UQ52 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CNTN6Q9UQ52 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CNTN6Q9UQ52 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CNTN6Q9UQ52 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CNTN6Q9UQ52 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CNTN6Q9UQ52 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CNTN6Q9UQ52 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CNTN6Q9UQ52 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CNTN6Q9UQ52 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CNTN6Q9UQ52 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CNTN6Q9UQ52 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CNTN6Q9UQ52 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CNTN6Q9UQ52 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CNTN6Q9UQ52 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CNTN6Q9UQ52 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CNTN6Q9UQ52 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CNTN6Q9UQ52 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CNTN6Q9UQ52 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CNTN6Q9UQ52 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CNTN6Q9UQ52 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CNTN6Q9UQ52 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CNTN6Q9UQ52 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CNTN6Q9UQ52 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CNTN6Q9UQ52 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CNTN6Q9UQ52 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CNTN6Q9UQ52 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CNTN6Q9UQ52 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CNTN6Q9UQ52 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
CNTN6Q9UQ52 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CNTN6Q9UQ52 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CNTN6Q9UQ52 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CNTN6Q9UQ52 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms