Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNY4

TTF2, Transcription termination factor 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTF2Q9UNY4 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
TTF2Q9UNY4 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
TTF2Q9UNY4 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
TTF2Q9UNY4 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TTF2Q9UNY4 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TTF2Q9UNY4 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TTF2Q9UNY4 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TTF2Q9UNY4 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TTF2Q9UNY4 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TTF2Q9UNY4 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TTF2Q9UNY4 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TTF2Q9UNY4 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
TTF2Q9UNY4 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TTF2Q9UNY4 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TTF2Q9UNY4 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TTF2Q9UNY4 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TTF2Q9UNY4 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TTF2Q9UNY4 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TTF2Q9UNY4 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
TTF2Q9UNY4 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TTF2Q9UNY4 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
TTF2Q9UNY4 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
TTF2Q9UNY4 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
TTF2Q9UNY4 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
TTF2Q9UNY4 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
TTF2Q9UNY4 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
TTF2Q9UNY4 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TTF2Q9UNY4 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TTF2Q9UNY4 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TTF2Q9UNY4 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
TTF2Q9UNY4 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TTF2Q9UNY4 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
TTF2Q9UNY4 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
TTF2Q9UNY4 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
TTF2Q9UNY4 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
TTF2Q9UNY4 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
TTF2Q9UNY4 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TTF2Q9UNY4 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TTF2Q9UNY4 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TTF2Q9UNY4 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TTF2Q9UNY4 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TTF2Q9UNY4 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TTF2Q9UNY4 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TTF2Q9UNY4 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TTF2Q9UNY4 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
TTF2Q9UNY4 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
TTF2Q9UNY4 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TTF2Q9UNY4 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
TTF2Q9UNY4 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
TTF2Q9UNY4 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
TTF2Q9UNY4 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TTF2Q9UNY4 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TTF2Q9UNY4 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
TTF2Q9UNY4 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
TTF2Q9UNY4 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
TTF2Q9UNY4 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TTF2Q9UNY4 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TTF2Q9UNY4 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TTF2Q9UNY4 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
TTF2Q9UNY4 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
TTF2Q9UNY4 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
TTF2Q9UNY4 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
TTF2Q9UNY4 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TTF2Q9UNY4 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TTF2Q9UNY4 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
TTF2Q9UNY4 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
TTF2Q9UNY4 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
TTF2Q9UNY4 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
TTF2Q9UNY4 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC27.21■■□□□ 1.95
TTF2Q9UNY4 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
TTF2Q9UNY4 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
TTF2Q9UNY4 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
TTF2Q9UNY4 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TTF2Q9UNY4 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TTF2Q9UNY4 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
TTF2Q9UNY4 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
TTF2Q9UNY4 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
TTF2Q9UNY4 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
TTF2Q9UNY4 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
TTF2Q9UNY4 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
TTF2Q9UNY4 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
TTF2Q9UNY4 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
TTF2Q9UNY4 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
TTF2Q9UNY4 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
TTF2Q9UNY4 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TTF2Q9UNY4 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
TTF2Q9UNY4 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TTF2Q9UNY4 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
TTF2Q9UNY4 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
TTF2Q9UNY4 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
TTF2Q9UNY4 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TTF2Q9UNY4 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
TTF2Q9UNY4 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TTF2Q9UNY4 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TTF2Q9UNY4 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TTF2Q9UNY4 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TTF2Q9UNY4 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TTF2Q9UNY4 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
TTF2Q9UNY4 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TTF2Q9UNY4 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms