Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNQ0

ABCG2, ATP-binding cassette sub-family G member 2, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCG2Q9UNQ0 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.3■■□□□ 1
ABCG2Q9UNQ0 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ABCG2Q9UNQ0 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ABCG2Q9UNQ0 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ABCG2Q9UNQ0 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ABCG2Q9UNQ0 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ABCG2Q9UNQ0 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ABCG2Q9UNQ0 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ABCG2Q9UNQ0 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ABCG2Q9UNQ0 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ABCG2Q9UNQ0 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
ABCG2Q9UNQ0 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
ABCG2Q9UNQ0 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
ABCG2Q9UNQ0 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ABCG2Q9UNQ0 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ABCG2Q9UNQ0 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ABCG2Q9UNQ0 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ABCG2Q9UNQ0 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ABCG2Q9UNQ0 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ABCG2Q9UNQ0 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ABCG2Q9UNQ0 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ABCG2Q9UNQ0 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ABCG2Q9UNQ0 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ABCG2Q9UNQ0 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ABCG2Q9UNQ0 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ABCG2Q9UNQ0 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
ABCG2Q9UNQ0 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
ABCG2Q9UNQ0 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ABCG2Q9UNQ0 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC21.28■■□□□ 1
ABCG2Q9UNQ0 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ABCG2Q9UNQ0 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC21.28■■□□□ 1
ABCG2Q9UNQ0 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ABCG2Q9UNQ0 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ABCG2Q9UNQ0 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ABCG2Q9UNQ0 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ABCG2Q9UNQ0 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ABCG2Q9UNQ0 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ABCG2Q9UNQ0 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ABCG2Q9UNQ0 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ABCG2Q9UNQ0 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ABCG2Q9UNQ0 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ABCG2Q9UNQ0 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ABCG2Q9UNQ0 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ABCG2Q9UNQ0 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ABCG2Q9UNQ0 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ABCG2Q9UNQ0 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ABCG2Q9UNQ0 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ABCG2Q9UNQ0 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.27■■□□□ 1
ABCG2Q9UNQ0 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ABCG2Q9UNQ0 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ABCG2Q9UNQ0 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ABCG2Q9UNQ0 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
ABCG2Q9UNQ0 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ABCG2Q9UNQ0 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ABCG2Q9UNQ0 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ABCG2Q9UNQ0 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ABCG2Q9UNQ0 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ABCG2Q9UNQ0 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ABCG2Q9UNQ0 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ABCG2Q9UNQ0 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ABCG2Q9UNQ0 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ABCG2Q9UNQ0 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
ABCG2Q9UNQ0 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ABCG2Q9UNQ0 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ABCG2Q9UNQ0 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ABCG2Q9UNQ0 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
ABCG2Q9UNQ0 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
ABCG2Q9UNQ0 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
ABCG2Q9UNQ0 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ABCG2Q9UNQ0 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ABCG2Q9UNQ0 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
ABCG2Q9UNQ0 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ABCG2Q9UNQ0 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ABCG2Q9UNQ0 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ABCG2Q9UNQ0 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ABCG2Q9UNQ0 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ABCG2Q9UNQ0 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ABCG2Q9UNQ0 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ABCG2Q9UNQ0 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ABCG2Q9UNQ0 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ABCG2Q9UNQ0 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ABCG2Q9UNQ0 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ABCG2Q9UNQ0 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ABCG2Q9UNQ0 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ABCG2Q9UNQ0 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ABCG2Q9UNQ0 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ABCG2Q9UNQ0 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ABCG2Q9UNQ0 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ABCG2Q9UNQ0 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ABCG2Q9UNQ0 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ABCG2Q9UNQ0 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ABCG2Q9UNQ0 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ABCG2Q9UNQ0 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ABCG2Q9UNQ0 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ABCG2Q9UNQ0 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ABCG2Q9UNQ0 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ABCG2Q9UNQ0 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ABCG2Q9UNQ0 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ABCG2Q9UNQ0 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ABCG2Q9UNQ0 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms