Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN30

SCML1, Sex comb on midleg-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCML1Q9UN30 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SCML1Q9UN30 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SCML1Q9UN30 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SCML1Q9UN30 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SCML1Q9UN30 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SCML1Q9UN30 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SCML1Q9UN30 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SCML1Q9UN30 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SCML1Q9UN30 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SCML1Q9UN30 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SCML1Q9UN30 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
SCML1Q9UN30 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SCML1Q9UN30 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SCML1Q9UN30 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SCML1Q9UN30 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SCML1Q9UN30 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
SCML1Q9UN30 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
SCML1Q9UN30 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SCML1Q9UN30 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
SCML1Q9UN30 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
SCML1Q9UN30 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SCML1Q9UN30 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SCML1Q9UN30 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SCML1Q9UN30 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SCML1Q9UN30 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SCML1Q9UN30 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SCML1Q9UN30 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SCML1Q9UN30 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SCML1Q9UN30 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SCML1Q9UN30 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SCML1Q9UN30 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SCML1Q9UN30 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SCML1Q9UN30 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SCML1Q9UN30 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SCML1Q9UN30 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SCML1Q9UN30 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SCML1Q9UN30 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SCML1Q9UN30 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SCML1Q9UN30 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SCML1Q9UN30 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SCML1Q9UN30 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SCML1Q9UN30 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SCML1Q9UN30 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
SCML1Q9UN30 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SCML1Q9UN30 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SCML1Q9UN30 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SCML1Q9UN30 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SCML1Q9UN30 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SCML1Q9UN30 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SCML1Q9UN30 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SCML1Q9UN30 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SCML1Q9UN30 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SCML1Q9UN30 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SCML1Q9UN30 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SCML1Q9UN30 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SCML1Q9UN30 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SCML1Q9UN30 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SCML1Q9UN30 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SCML1Q9UN30 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SCML1Q9UN30 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SCML1Q9UN30 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SCML1Q9UN30 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SCML1Q9UN30 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SCML1Q9UN30 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SCML1Q9UN30 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SCML1Q9UN30 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SCML1Q9UN30 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SCML1Q9UN30 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SCML1Q9UN30 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SCML1Q9UN30 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SCML1Q9UN30 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SCML1Q9UN30 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SCML1Q9UN30 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SCML1Q9UN30 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SCML1Q9UN30 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SCML1Q9UN30 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SCML1Q9UN30 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SCML1Q9UN30 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SCML1Q9UN30 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SCML1Q9UN30 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SCML1Q9UN30 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SCML1Q9UN30 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SCML1Q9UN30 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SCML1Q9UN30 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SCML1Q9UN30 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SCML1Q9UN30 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
SCML1Q9UN30 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SCML1Q9UN30 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SCML1Q9UN30 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SCML1Q9UN30 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SCML1Q9UN30 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SCML1Q9UN30 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SCML1Q9UN30 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
SCML1Q9UN30 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
SCML1Q9UN30 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SCML1Q9UN30 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SCML1Q9UN30 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SCML1Q9UN30 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SCML1Q9UN30 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SCML1Q9UN30 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms