Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMW8

USP18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, humanhuman

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP18Q9UMW8 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
USP18Q9UMW8 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.83■■□□□ 1.4
USP18Q9UMW8 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
USP18Q9UMW8 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
USP18Q9UMW8 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
USP18Q9UMW8 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
USP18Q9UMW8 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
USP18Q9UMW8 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
USP18Q9UMW8 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
USP18Q9UMW8 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
USP18Q9UMW8 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
USP18Q9UMW8 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
USP18Q9UMW8 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
USP18Q9UMW8 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
USP18Q9UMW8 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
USP18Q9UMW8 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
USP18Q9UMW8 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
USP18Q9UMW8 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
USP18Q9UMW8 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
USP18Q9UMW8 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
USP18Q9UMW8 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
USP18Q9UMW8 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
USP18Q9UMW8 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
USP18Q9UMW8 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
USP18Q9UMW8 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
USP18Q9UMW8 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
USP18Q9UMW8 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
USP18Q9UMW8 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
USP18Q9UMW8 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
USP18Q9UMW8 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
USP18Q9UMW8 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
USP18Q9UMW8 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
USP18Q9UMW8 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
USP18Q9UMW8 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
USP18Q9UMW8 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
USP18Q9UMW8 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
USP18Q9UMW8 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
USP18Q9UMW8 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
USP18Q9UMW8 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
USP18Q9UMW8 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
USP18Q9UMW8 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
USP18Q9UMW8 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
USP18Q9UMW8 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
USP18Q9UMW8 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
USP18Q9UMW8 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
USP18Q9UMW8 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
USP18Q9UMW8 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
USP18Q9UMW8 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
USP18Q9UMW8 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
USP18Q9UMW8 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
USP18Q9UMW8 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
USP18Q9UMW8 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
USP18Q9UMW8 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
USP18Q9UMW8 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
USP18Q9UMW8 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
USP18Q9UMW8 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
USP18Q9UMW8 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
USP18Q9UMW8 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
USP18Q9UMW8 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
USP18Q9UMW8 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
USP18Q9UMW8 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
USP18Q9UMW8 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
USP18Q9UMW8 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
USP18Q9UMW8 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
USP18Q9UMW8 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
USP18Q9UMW8 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
USP18Q9UMW8 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
USP18Q9UMW8 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
USP18Q9UMW8 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
USP18Q9UMW8 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
USP18Q9UMW8 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
USP18Q9UMW8 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
USP18Q9UMW8 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
USP18Q9UMW8 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
USP18Q9UMW8 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
USP18Q9UMW8 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
USP18Q9UMW8 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
USP18Q9UMW8 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
USP18Q9UMW8 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
USP18Q9UMW8 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
USP18Q9UMW8 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
USP18Q9UMW8 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
USP18Q9UMW8 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
USP18Q9UMW8 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
USP18Q9UMW8 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
USP18Q9UMW8 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
USP18Q9UMW8 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
USP18Q9UMW8 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
USP18Q9UMW8 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
USP18Q9UMW8 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
USP18Q9UMW8 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
USP18Q9UMW8 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
USP18Q9UMW8 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
USP18Q9UMW8 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
USP18Q9UMW8 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
USP18Q9UMW8 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
USP18Q9UMW8 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
USP18Q9UMW8 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
USP18Q9UMW8 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
USP18Q9UMW8 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
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