Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMS6

SYNPO2, Synaptopodin-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNPO2Q9UMS6 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
SYNPO2Q9UMS6 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SYNPO2Q9UMS6 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SYNPO2Q9UMS6 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SYNPO2Q9UMS6 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SYNPO2Q9UMS6 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SYNPO2Q9UMS6 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SYNPO2Q9UMS6 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SYNPO2Q9UMS6 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SYNPO2Q9UMS6 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SYNPO2Q9UMS6 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SYNPO2Q9UMS6 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SYNPO2Q9UMS6 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SYNPO2Q9UMS6 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SYNPO2Q9UMS6 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SYNPO2Q9UMS6 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SYNPO2Q9UMS6 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SYNPO2Q9UMS6 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SYNPO2Q9UMS6 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SYNPO2Q9UMS6 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SYNPO2Q9UMS6 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
SYNPO2Q9UMS6 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SYNPO2Q9UMS6 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SYNPO2Q9UMS6 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SYNPO2Q9UMS6 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
SYNPO2Q9UMS6 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SYNPO2Q9UMS6 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SYNPO2Q9UMS6 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SYNPO2Q9UMS6 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SYNPO2Q9UMS6 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SYNPO2Q9UMS6 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SYNPO2Q9UMS6 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SYNPO2Q9UMS6 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SYNPO2Q9UMS6 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SYNPO2Q9UMS6 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SYNPO2Q9UMS6 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SYNPO2Q9UMS6 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SYNPO2Q9UMS6 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SYNPO2Q9UMS6 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SYNPO2Q9UMS6 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SYNPO2Q9UMS6 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SYNPO2Q9UMS6 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SYNPO2Q9UMS6 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SYNPO2Q9UMS6 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SYNPO2Q9UMS6 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SYNPO2Q9UMS6 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SYNPO2Q9UMS6 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SYNPO2Q9UMS6 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SYNPO2Q9UMS6 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SYNPO2Q9UMS6 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SYNPO2Q9UMS6 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SYNPO2Q9UMS6 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SYNPO2Q9UMS6 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
SYNPO2Q9UMS6 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SYNPO2Q9UMS6 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SYNPO2Q9UMS6 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SYNPO2Q9UMS6 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SYNPO2Q9UMS6 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SYNPO2Q9UMS6 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SYNPO2Q9UMS6 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SYNPO2Q9UMS6 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SYNPO2Q9UMS6 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
SYNPO2Q9UMS6 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SYNPO2Q9UMS6 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SYNPO2Q9UMS6 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SYNPO2Q9UMS6 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SYNPO2Q9UMS6 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SYNPO2Q9UMS6 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SYNPO2Q9UMS6 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SYNPO2Q9UMS6 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SYNPO2Q9UMS6 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SYNPO2Q9UMS6 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SYNPO2Q9UMS6 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
SYNPO2Q9UMS6 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SYNPO2Q9UMS6 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
SYNPO2Q9UMS6 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
SYNPO2Q9UMS6 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SYNPO2Q9UMS6 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
SYNPO2Q9UMS6 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
SYNPO2Q9UMS6 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
SYNPO2Q9UMS6 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SYNPO2Q9UMS6 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SYNPO2Q9UMS6 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SYNPO2Q9UMS6 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SYNPO2Q9UMS6 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SYNPO2Q9UMS6 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SYNPO2Q9UMS6 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SYNPO2Q9UMS6 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SYNPO2Q9UMS6 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SYNPO2Q9UMS6 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SYNPO2Q9UMS6 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SYNPO2Q9UMS6 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
SYNPO2Q9UMS6 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SYNPO2Q9UMS6 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SYNPO2Q9UMS6 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
SYNPO2Q9UMS6 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
SYNPO2Q9UMS6 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
SYNPO2Q9UMS6 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SYNPO2Q9UMS6 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SYNPO2Q9UMS6 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.8 ms