Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMS4

PRPF19, Pre-mRNA-processing factor 19, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF19Q9UMS4 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PRPF19Q9UMS4 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PRPF19Q9UMS4 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PRPF19Q9UMS4 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PRPF19Q9UMS4 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PRPF19Q9UMS4 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PRPF19Q9UMS4 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PRPF19Q9UMS4 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PRPF19Q9UMS4 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PRPF19Q9UMS4 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PRPF19Q9UMS4 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PRPF19Q9UMS4 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PRPF19Q9UMS4 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PRPF19Q9UMS4 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PRPF19Q9UMS4 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PRPF19Q9UMS4 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PRPF19Q9UMS4 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PRPF19Q9UMS4 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PRPF19Q9UMS4 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PRPF19Q9UMS4 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PRPF19Q9UMS4 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PRPF19Q9UMS4 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PRPF19Q9UMS4 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PRPF19Q9UMS4 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PRPF19Q9UMS4 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PRPF19Q9UMS4 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PRPF19Q9UMS4 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PRPF19Q9UMS4 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PRPF19Q9UMS4 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PRPF19Q9UMS4 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PRPF19Q9UMS4 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PRPF19Q9UMS4 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PRPF19Q9UMS4 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PRPF19Q9UMS4 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PRPF19Q9UMS4 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PRPF19Q9UMS4 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PRPF19Q9UMS4 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PRPF19Q9UMS4 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
PRPF19Q9UMS4 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
PRPF19Q9UMS4 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PRPF19Q9UMS4 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PRPF19Q9UMS4 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PRPF19Q9UMS4 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PRPF19Q9UMS4 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PRPF19Q9UMS4 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PRPF19Q9UMS4 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PRPF19Q9UMS4 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PRPF19Q9UMS4 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
PRPF19Q9UMS4 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PRPF19Q9UMS4 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PRPF19Q9UMS4 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PRPF19Q9UMS4 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PRPF19Q9UMS4 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PRPF19Q9UMS4 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PRPF19Q9UMS4 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PRPF19Q9UMS4 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PRPF19Q9UMS4 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PRPF19Q9UMS4 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PRPF19Q9UMS4 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PRPF19Q9UMS4 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PRPF19Q9UMS4 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PRPF19Q9UMS4 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PRPF19Q9UMS4 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
PRPF19Q9UMS4 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PRPF19Q9UMS4 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PRPF19Q9UMS4 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PRPF19Q9UMS4 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
PRPF19Q9UMS4 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
PRPF19Q9UMS4 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRPF19Q9UMS4 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRPF19Q9UMS4 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRPF19Q9UMS4 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRPF19Q9UMS4 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
PRPF19Q9UMS4 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRPF19Q9UMS4 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRPF19Q9UMS4 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRPF19Q9UMS4 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRPF19Q9UMS4 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRPF19Q9UMS4 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
PRPF19Q9UMS4 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRPF19Q9UMS4 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRPF19Q9UMS4 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRPF19Q9UMS4 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRPF19Q9UMS4 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRPF19Q9UMS4 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRPF19Q9UMS4 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRPF19Q9UMS4 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRPF19Q9UMS4 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRPF19Q9UMS4 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRPF19Q9UMS4 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRPF19Q9UMS4 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRPF19Q9UMS4 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRPF19Q9UMS4 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRPF19Q9UMS4 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRPF19Q9UMS4 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRPF19Q9UMS4 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRPF19Q9UMS4 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRPF19Q9UMS4 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRPF19Q9UMS4 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRPF19Q9UMS4 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms