Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULE3

DENND2A, DENN domain-containing protein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 1,009 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DENND2AQ9ULE3 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
DENND2AQ9ULE3 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
DENND2AQ9ULE3 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
DENND2AQ9ULE3 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
DENND2AQ9ULE3 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
DENND2AQ9ULE3 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
DENND2AQ9ULE3 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
DENND2AQ9ULE3 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
DENND2AQ9ULE3 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
DENND2AQ9ULE3 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
DENND2AQ9ULE3 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
DENND2AQ9ULE3 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
DENND2AQ9ULE3 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
DENND2AQ9ULE3 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
DENND2AQ9ULE3 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
DENND2AQ9ULE3 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
DENND2AQ9ULE3 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
DENND2AQ9ULE3 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
DENND2AQ9ULE3 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
DENND2AQ9ULE3 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
DENND2AQ9ULE3 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
DENND2AQ9ULE3 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
DENND2AQ9ULE3 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
DENND2AQ9ULE3 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
DENND2AQ9ULE3 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
DENND2AQ9ULE3 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
DENND2AQ9ULE3 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
DENND2AQ9ULE3 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
DENND2AQ9ULE3 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
DENND2AQ9ULE3 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
DENND2AQ9ULE3 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
DENND2AQ9ULE3 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
DENND2AQ9ULE3 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
DENND2AQ9ULE3 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
DENND2AQ9ULE3 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
DENND2AQ9ULE3 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
DENND2AQ9ULE3 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
DENND2AQ9ULE3 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
DENND2AQ9ULE3 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
DENND2AQ9ULE3 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
DENND2AQ9ULE3 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
DENND2AQ9ULE3 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
DENND2AQ9ULE3 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
DENND2AQ9ULE3 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
DENND2AQ9ULE3 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
DENND2AQ9ULE3 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
DENND2AQ9ULE3 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
DENND2AQ9ULE3 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
DENND2AQ9ULE3 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
DENND2AQ9ULE3 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
DENND2AQ9ULE3 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
DENND2AQ9ULE3 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
DENND2AQ9ULE3 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
DENND2AQ9ULE3 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
DENND2AQ9ULE3 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
DENND2AQ9ULE3 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
DENND2AQ9ULE3 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
DENND2AQ9ULE3 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
DENND2AQ9ULE3 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
DENND2AQ9ULE3 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
DENND2AQ9ULE3 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
DENND2AQ9ULE3 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
DENND2AQ9ULE3 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
DENND2AQ9ULE3 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
DENND2AQ9ULE3 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
DENND2AQ9ULE3 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
DENND2AQ9ULE3 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
DENND2AQ9ULE3 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
DENND2AQ9ULE3 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
DENND2AQ9ULE3 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
DENND2AQ9ULE3 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
DENND2AQ9ULE3 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
DENND2AQ9ULE3 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
DENND2AQ9ULE3 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
DENND2AQ9ULE3 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
DENND2AQ9ULE3 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
DENND2AQ9ULE3 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
DENND2AQ9ULE3 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
DENND2AQ9ULE3 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
DENND2AQ9ULE3 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
DENND2AQ9ULE3 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
DENND2AQ9ULE3 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
DENND2AQ9ULE3 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
DENND2AQ9ULE3 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
DENND2AQ9ULE3 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
DENND2AQ9ULE3 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
DENND2AQ9ULE3 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
DENND2AQ9ULE3 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
DENND2AQ9ULE3 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
DENND2AQ9ULE3 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
DENND2AQ9ULE3 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
DENND2AQ9ULE3 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
DENND2AQ9ULE3 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
DENND2AQ9ULE3 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
DENND2AQ9ULE3 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
DENND2AQ9ULE3 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
DENND2AQ9ULE3 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
DENND2AQ9ULE3 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
DENND2AQ9ULE3 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
DENND2AQ9ULE3 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms