Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL33

TRAPPC2L, Trafficking protein particle complex subunit 2-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC2LQ9UL33 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRAPPC2LQ9UL33 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRAPPC2LQ9UL33 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRAPPC2LQ9UL33 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRAPPC2LQ9UL33 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRAPPC2LQ9UL33 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRAPPC2LQ9UL33 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
TRAPPC2LQ9UL33 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRAPPC2LQ9UL33 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRAPPC2LQ9UL33 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRAPPC2LQ9UL33 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRAPPC2LQ9UL33 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRAPPC2LQ9UL33 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRAPPC2LQ9UL33 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
TRAPPC2LQ9UL33 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRAPPC2LQ9UL33 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRAPPC2LQ9UL33 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRAPPC2LQ9UL33 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRAPPC2LQ9UL33 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRAPPC2LQ9UL33 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRAPPC2LQ9UL33 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRAPPC2LQ9UL33 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRAPPC2LQ9UL33 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRAPPC2LQ9UL33 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRAPPC2LQ9UL33 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRAPPC2LQ9UL33 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRAPPC2LQ9UL33 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRAPPC2LQ9UL33 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRAPPC2LQ9UL33 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRAPPC2LQ9UL33 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TRAPPC2LQ9UL33 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TRAPPC2LQ9UL33 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TRAPPC2LQ9UL33 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TRAPPC2LQ9UL33 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
TRAPPC2LQ9UL33 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TRAPPC2LQ9UL33 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TRAPPC2LQ9UL33 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
TRAPPC2LQ9UL33 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TRAPPC2LQ9UL33 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TRAPPC2LQ9UL33 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TRAPPC2LQ9UL33 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TRAPPC2LQ9UL33 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TRAPPC2LQ9UL33 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TRAPPC2LQ9UL33 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TRAPPC2LQ9UL33 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TRAPPC2LQ9UL33 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TRAPPC2LQ9UL33 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TRAPPC2LQ9UL33 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TRAPPC2LQ9UL33 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TRAPPC2LQ9UL33 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TRAPPC2LQ9UL33 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TRAPPC2LQ9UL33 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TRAPPC2LQ9UL33 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TRAPPC2LQ9UL33 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TRAPPC2LQ9UL33 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TRAPPC2LQ9UL33 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TRAPPC2LQ9UL33 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TRAPPC2LQ9UL33 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TRAPPC2LQ9UL33 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TRAPPC2LQ9UL33 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
TRAPPC2LQ9UL33 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
TRAPPC2LQ9UL33 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TRAPPC2LQ9UL33 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TRAPPC2LQ9UL33 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TRAPPC2LQ9UL33 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TRAPPC2LQ9UL33 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TRAPPC2LQ9UL33 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TRAPPC2LQ9UL33 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TRAPPC2LQ9UL33 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TRAPPC2LQ9UL33 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TRAPPC2LQ9UL33 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TRAPPC2LQ9UL33 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
TRAPPC2LQ9UL33 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TRAPPC2LQ9UL33 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TRAPPC2LQ9UL33 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TRAPPC2LQ9UL33 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TRAPPC2LQ9UL33 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TRAPPC2LQ9UL33 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRAPPC2LQ9UL33 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRAPPC2LQ9UL33 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRAPPC2LQ9UL33 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRAPPC2LQ9UL33 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRAPPC2LQ9UL33 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRAPPC2LQ9UL33 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRAPPC2LQ9UL33 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRAPPC2LQ9UL33 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRAPPC2LQ9UL33 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRAPPC2LQ9UL33 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRAPPC2LQ9UL33 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TRAPPC2LQ9UL33 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TRAPPC2LQ9UL33 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TRAPPC2LQ9UL33 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TRAPPC2LQ9UL33 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TRAPPC2LQ9UL33 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
TRAPPC2LQ9UL33 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TRAPPC2LQ9UL33 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TRAPPC2LQ9UL33 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
TRAPPC2LQ9UL33 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TRAPPC2LQ9UL33 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRAPPC2LQ9UL33 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms