Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKI2

CDC42EP3, Cdc42 effector protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42EP3Q9UKI2 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CDC42EP3Q9UKI2 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CDC42EP3Q9UKI2 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CDC42EP3Q9UKI2 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CDC42EP3Q9UKI2 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CDC42EP3Q9UKI2 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CDC42EP3Q9UKI2 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CDC42EP3Q9UKI2 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CDC42EP3Q9UKI2 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CDC42EP3Q9UKI2 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CDC42EP3Q9UKI2 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CDC42EP3Q9UKI2 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CDC42EP3Q9UKI2 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CDC42EP3Q9UKI2 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CDC42EP3Q9UKI2 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CDC42EP3Q9UKI2 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CDC42EP3Q9UKI2 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CDC42EP3Q9UKI2 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CDC42EP3Q9UKI2 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CDC42EP3Q9UKI2 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CDC42EP3Q9UKI2 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CDC42EP3Q9UKI2 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CDC42EP3Q9UKI2 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CDC42EP3Q9UKI2 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CDC42EP3Q9UKI2 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CDC42EP3Q9UKI2 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CDC42EP3Q9UKI2 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CDC42EP3Q9UKI2 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CDC42EP3Q9UKI2 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CDC42EP3Q9UKI2 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CDC42EP3Q9UKI2 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CDC42EP3Q9UKI2 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CDC42EP3Q9UKI2 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CDC42EP3Q9UKI2 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CDC42EP3Q9UKI2 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CDC42EP3Q9UKI2 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CDC42EP3Q9UKI2 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CDC42EP3Q9UKI2 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CDC42EP3Q9UKI2 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CDC42EP3Q9UKI2 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CDC42EP3Q9UKI2 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CDC42EP3Q9UKI2 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CDC42EP3Q9UKI2 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CDC42EP3Q9UKI2 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CDC42EP3Q9UKI2 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CDC42EP3Q9UKI2 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CDC42EP3Q9UKI2 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CDC42EP3Q9UKI2 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CDC42EP3Q9UKI2 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CDC42EP3Q9UKI2 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CDC42EP3Q9UKI2 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CDC42EP3Q9UKI2 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CDC42EP3Q9UKI2 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CDC42EP3Q9UKI2 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CDC42EP3Q9UKI2 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CDC42EP3Q9UKI2 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CDC42EP3Q9UKI2 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CDC42EP3Q9UKI2 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CDC42EP3Q9UKI2 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CDC42EP3Q9UKI2 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CDC42EP3Q9UKI2 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CDC42EP3Q9UKI2 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CDC42EP3Q9UKI2 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
CDC42EP3Q9UKI2 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CDC42EP3Q9UKI2 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CDC42EP3Q9UKI2 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
CDC42EP3Q9UKI2 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CDC42EP3Q9UKI2 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CDC42EP3Q9UKI2 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CDC42EP3Q9UKI2 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CDC42EP3Q9UKI2 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CDC42EP3Q9UKI2 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CDC42EP3Q9UKI2 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CDC42EP3Q9UKI2 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CDC42EP3Q9UKI2 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
CDC42EP3Q9UKI2 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
CDC42EP3Q9UKI2 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
CDC42EP3Q9UKI2 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CDC42EP3Q9UKI2 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CDC42EP3Q9UKI2 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CDC42EP3Q9UKI2 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CDC42EP3Q9UKI2 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CDC42EP3Q9UKI2 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CDC42EP3Q9UKI2 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CDC42EP3Q9UKI2 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CDC42EP3Q9UKI2 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CDC42EP3Q9UKI2 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CDC42EP3Q9UKI2 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CDC42EP3Q9UKI2 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CDC42EP3Q9UKI2 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CDC42EP3Q9UKI2 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CDC42EP3Q9UKI2 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CDC42EP3Q9UKI2 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CDC42EP3Q9UKI2 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CDC42EP3Q9UKI2 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CDC42EP3Q9UKI2 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CDC42EP3Q9UKI2 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CDC42EP3Q9UKI2 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CDC42EP3Q9UKI2 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CDC42EP3Q9UKI2 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms