Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJX2

CDC23, Cell division cycle protein 23 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 597 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC23Q9UJX2 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CDC23Q9UJX2 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CDC23Q9UJX2 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CDC23Q9UJX2 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CDC23Q9UJX2 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CDC23Q9UJX2 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CDC23Q9UJX2 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CDC23Q9UJX2 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CDC23Q9UJX2 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CDC23Q9UJX2 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CDC23Q9UJX2 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CDC23Q9UJX2 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CDC23Q9UJX2 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CDC23Q9UJX2 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CDC23Q9UJX2 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CDC23Q9UJX2 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CDC23Q9UJX2 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CDC23Q9UJX2 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CDC23Q9UJX2 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CDC23Q9UJX2 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CDC23Q9UJX2 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CDC23Q9UJX2 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CDC23Q9UJX2 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CDC23Q9UJX2 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CDC23Q9UJX2 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CDC23Q9UJX2 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CDC23Q9UJX2 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CDC23Q9UJX2 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CDC23Q9UJX2 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CDC23Q9UJX2 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CDC23Q9UJX2 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CDC23Q9UJX2 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CDC23Q9UJX2 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CDC23Q9UJX2 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CDC23Q9UJX2 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CDC23Q9UJX2 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CDC23Q9UJX2 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CDC23Q9UJX2 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
CDC23Q9UJX2 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
CDC23Q9UJX2 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CDC23Q9UJX2 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CDC23Q9UJX2 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CDC23Q9UJX2 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CDC23Q9UJX2 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CDC23Q9UJX2 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CDC23Q9UJX2 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CDC23Q9UJX2 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CDC23Q9UJX2 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CDC23Q9UJX2 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CDC23Q9UJX2 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CDC23Q9UJX2 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CDC23Q9UJX2 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CDC23Q9UJX2 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CDC23Q9UJX2 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CDC23Q9UJX2 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CDC23Q9UJX2 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
CDC23Q9UJX2 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CDC23Q9UJX2 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CDC23Q9UJX2 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CDC23Q9UJX2 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CDC23Q9UJX2 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CDC23Q9UJX2 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CDC23Q9UJX2 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CDC23Q9UJX2 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CDC23Q9UJX2 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CDC23Q9UJX2 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CDC23Q9UJX2 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CDC23Q9UJX2 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CDC23Q9UJX2 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CDC23Q9UJX2 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CDC23Q9UJX2 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CDC23Q9UJX2 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CDC23Q9UJX2 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CDC23Q9UJX2 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CDC23Q9UJX2 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CDC23Q9UJX2 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CDC23Q9UJX2 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CDC23Q9UJX2 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CDC23Q9UJX2 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CDC23Q9UJX2 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CDC23Q9UJX2 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CDC23Q9UJX2 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CDC23Q9UJX2 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CDC23Q9UJX2 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
CDC23Q9UJX2 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CDC23Q9UJX2 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CDC23Q9UJX2 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CDC23Q9UJX2 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CDC23Q9UJX2 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CDC23Q9UJX2 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CDC23Q9UJX2 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CDC23Q9UJX2 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CDC23Q9UJX2 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CDC23Q9UJX2 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CDC23Q9UJX2 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CDC23Q9UJX2 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CDC23Q9UJX2 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CDC23Q9UJX2 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CDC23Q9UJX2 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CDC23Q9UJX2 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms