Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJA3

MCM8, DNA helicase MCM8, humanhuman

Predictions only

Length 840 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCM8Q9UJA3 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MCM8Q9UJA3 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MCM8Q9UJA3 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MCM8Q9UJA3 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MCM8Q9UJA3 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MCM8Q9UJA3 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MCM8Q9UJA3 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MCM8Q9UJA3 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MCM8Q9UJA3 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MCM8Q9UJA3 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MCM8Q9UJA3 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
MCM8Q9UJA3 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
MCM8Q9UJA3 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MCM8Q9UJA3 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MCM8Q9UJA3 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MCM8Q9UJA3 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MCM8Q9UJA3 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MCM8Q9UJA3 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MCM8Q9UJA3 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MCM8Q9UJA3 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MCM8Q9UJA3 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MCM8Q9UJA3 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MCM8Q9UJA3 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
MCM8Q9UJA3 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MCM8Q9UJA3 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MCM8Q9UJA3 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MCM8Q9UJA3 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MCM8Q9UJA3 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MCM8Q9UJA3 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MCM8Q9UJA3 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MCM8Q9UJA3 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MCM8Q9UJA3 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MCM8Q9UJA3 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MCM8Q9UJA3 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MCM8Q9UJA3 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MCM8Q9UJA3 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MCM8Q9UJA3 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MCM8Q9UJA3 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MCM8Q9UJA3 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MCM8Q9UJA3 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MCM8Q9UJA3 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
MCM8Q9UJA3 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MCM8Q9UJA3 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MCM8Q9UJA3 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MCM8Q9UJA3 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MCM8Q9UJA3 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MCM8Q9UJA3 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
MCM8Q9UJA3 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
MCM8Q9UJA3 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
MCM8Q9UJA3 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
MCM8Q9UJA3 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MCM8Q9UJA3 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MCM8Q9UJA3 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MCM8Q9UJA3 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MCM8Q9UJA3 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MCM8Q9UJA3 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MCM8Q9UJA3 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MCM8Q9UJA3 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MCM8Q9UJA3 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MCM8Q9UJA3 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
MCM8Q9UJA3 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MCM8Q9UJA3 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MCM8Q9UJA3 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MCM8Q9UJA3 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MCM8Q9UJA3 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MCM8Q9UJA3 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MCM8Q9UJA3 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MCM8Q9UJA3 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MCM8Q9UJA3 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MCM8Q9UJA3 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MCM8Q9UJA3 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MCM8Q9UJA3 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MCM8Q9UJA3 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MCM8Q9UJA3 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MCM8Q9UJA3 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MCM8Q9UJA3 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MCM8Q9UJA3 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MCM8Q9UJA3 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MCM8Q9UJA3 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MCM8Q9UJA3 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MCM8Q9UJA3 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MCM8Q9UJA3 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MCM8Q9UJA3 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MCM8Q9UJA3 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MCM8Q9UJA3 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MCM8Q9UJA3 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MCM8Q9UJA3 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MCM8Q9UJA3 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
MCM8Q9UJA3 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MCM8Q9UJA3 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MCM8Q9UJA3 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MCM8Q9UJA3 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MCM8Q9UJA3 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MCM8Q9UJA3 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MCM8Q9UJA3 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MCM8Q9UJA3 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MCM8Q9UJA3 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MCM8Q9UJA3 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MCM8Q9UJA3 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MCM8Q9UJA3 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms