Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIW0

VAX2, Ventral anterior homeobox 2, humanhuman

Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAX2Q9UIW0 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
VAX2Q9UIW0 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
VAX2Q9UIW0 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
VAX2Q9UIW0 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
VAX2Q9UIW0 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
VAX2Q9UIW0 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
VAX2Q9UIW0 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
VAX2Q9UIW0 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
VAX2Q9UIW0 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
VAX2Q9UIW0 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
VAX2Q9UIW0 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
VAX2Q9UIW0 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
VAX2Q9UIW0 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
VAX2Q9UIW0 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
VAX2Q9UIW0 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
VAX2Q9UIW0 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
VAX2Q9UIW0 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
VAX2Q9UIW0 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
VAX2Q9UIW0 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
VAX2Q9UIW0 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
VAX2Q9UIW0 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
VAX2Q9UIW0 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
VAX2Q9UIW0 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
VAX2Q9UIW0 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
VAX2Q9UIW0 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
VAX2Q9UIW0 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
VAX2Q9UIW0 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
VAX2Q9UIW0 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
VAX2Q9UIW0 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
VAX2Q9UIW0 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
VAX2Q9UIW0 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
VAX2Q9UIW0 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
VAX2Q9UIW0 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
VAX2Q9UIW0 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
VAX2Q9UIW0 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
VAX2Q9UIW0 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC17.66■□□□□ 0.42
VAX2Q9UIW0 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
VAX2Q9UIW0 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
VAX2Q9UIW0 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
VAX2Q9UIW0 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
VAX2Q9UIW0 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
VAX2Q9UIW0 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
VAX2Q9UIW0 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
VAX2Q9UIW0 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
VAX2Q9UIW0 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
VAX2Q9UIW0 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
VAX2Q9UIW0 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
VAX2Q9UIW0 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
VAX2Q9UIW0 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
VAX2Q9UIW0 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
VAX2Q9UIW0 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
VAX2Q9UIW0 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
VAX2Q9UIW0 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
VAX2Q9UIW0 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
VAX2Q9UIW0 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
VAX2Q9UIW0 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
VAX2Q9UIW0 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
VAX2Q9UIW0 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
VAX2Q9UIW0 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
VAX2Q9UIW0 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
VAX2Q9UIW0 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
VAX2Q9UIW0 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
VAX2Q9UIW0 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
VAX2Q9UIW0 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
VAX2Q9UIW0 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
VAX2Q9UIW0 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
VAX2Q9UIW0 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
VAX2Q9UIW0 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
VAX2Q9UIW0 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
VAX2Q9UIW0 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
VAX2Q9UIW0 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
VAX2Q9UIW0 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
VAX2Q9UIW0 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
VAX2Q9UIW0 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
VAX2Q9UIW0 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
VAX2Q9UIW0 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
VAX2Q9UIW0 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
VAX2Q9UIW0 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
VAX2Q9UIW0 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
VAX2Q9UIW0 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
VAX2Q9UIW0 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
VAX2Q9UIW0 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
VAX2Q9UIW0 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
VAX2Q9UIW0 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
VAX2Q9UIW0 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
VAX2Q9UIW0 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
VAX2Q9UIW0 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
VAX2Q9UIW0 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
VAX2Q9UIW0 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
VAX2Q9UIW0 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
VAX2Q9UIW0 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
VAX2Q9UIW0 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
VAX2Q9UIW0 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
VAX2Q9UIW0 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
VAX2Q9UIW0 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
VAX2Q9UIW0 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
VAX2Q9UIW0 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
VAX2Q9UIW0 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
VAX2Q9UIW0 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
VAX2Q9UIW0 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms