Protein–RNA interactions for Protein: Q9UII4

HERC5, E3 ISG15--protein ligase HERC5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC5Q9UII4 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
HERC5Q9UII4 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
HERC5Q9UII4 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
HERC5Q9UII4 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
HERC5Q9UII4 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
HERC5Q9UII4 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
HERC5Q9UII4 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
HERC5Q9UII4 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
HERC5Q9UII4 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
HERC5Q9UII4 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
HERC5Q9UII4 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
HERC5Q9UII4 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
HERC5Q9UII4 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
HERC5Q9UII4 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
HERC5Q9UII4 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
HERC5Q9UII4 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
HERC5Q9UII4 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
HERC5Q9UII4 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
HERC5Q9UII4 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
HERC5Q9UII4 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
HERC5Q9UII4 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
HERC5Q9UII4 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
HERC5Q9UII4 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
HERC5Q9UII4 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
HERC5Q9UII4 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
HERC5Q9UII4 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
HERC5Q9UII4 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
HERC5Q9UII4 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
HERC5Q9UII4 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
HERC5Q9UII4 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
HERC5Q9UII4 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
HERC5Q9UII4 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
HERC5Q9UII4 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
HERC5Q9UII4 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
HERC5Q9UII4 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
HERC5Q9UII4 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
HERC5Q9UII4 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
HERC5Q9UII4 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
HERC5Q9UII4 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
HERC5Q9UII4 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
HERC5Q9UII4 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
HERC5Q9UII4 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
HERC5Q9UII4 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
HERC5Q9UII4 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
HERC5Q9UII4 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
HERC5Q9UII4 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
HERC5Q9UII4 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
HERC5Q9UII4 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
HERC5Q9UII4 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
HERC5Q9UII4 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
HERC5Q9UII4 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
HERC5Q9UII4 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
HERC5Q9UII4 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
HERC5Q9UII4 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
HERC5Q9UII4 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
HERC5Q9UII4 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
HERC5Q9UII4 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
HERC5Q9UII4 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
HERC5Q9UII4 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
HERC5Q9UII4 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
HERC5Q9UII4 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
HERC5Q9UII4 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
HERC5Q9UII4 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
HERC5Q9UII4 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
HERC5Q9UII4 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
HERC5Q9UII4 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
HERC5Q9UII4 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC26.59■■□□□ 1.85
HERC5Q9UII4 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
HERC5Q9UII4 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
HERC5Q9UII4 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
HERC5Q9UII4 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
HERC5Q9UII4 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
HERC5Q9UII4 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
HERC5Q9UII4 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
HERC5Q9UII4 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
HERC5Q9UII4 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
HERC5Q9UII4 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
HERC5Q9UII4 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
HERC5Q9UII4 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
HERC5Q9UII4 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
HERC5Q9UII4 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
HERC5Q9UII4 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
HERC5Q9UII4 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
HERC5Q9UII4 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
HERC5Q9UII4 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
HERC5Q9UII4 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
HERC5Q9UII4 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
HERC5Q9UII4 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
HERC5Q9UII4 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
HERC5Q9UII4 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
HERC5Q9UII4 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
HERC5Q9UII4 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
HERC5Q9UII4 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
HERC5Q9UII4 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
HERC5Q9UII4 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
HERC5Q9UII4 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
HERC5Q9UII4 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
HERC5Q9UII4 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
HERC5Q9UII4 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
HERC5Q9UII4 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms