Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHP9

SMPX, Small muscular protein, humanhuman

Predictions only

Length 88 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMPXQ9UHP9 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SMPXQ9UHP9 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SMPXQ9UHP9 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SMPXQ9UHP9 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SMPXQ9UHP9 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SMPXQ9UHP9 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SMPXQ9UHP9 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SMPXQ9UHP9 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SMPXQ9UHP9 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SMPXQ9UHP9 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SMPXQ9UHP9 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SMPXQ9UHP9 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SMPXQ9UHP9 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SMPXQ9UHP9 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SMPXQ9UHP9 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SMPXQ9UHP9 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SMPXQ9UHP9 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SMPXQ9UHP9 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SMPXQ9UHP9 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SMPXQ9UHP9 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SMPXQ9UHP9 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SMPXQ9UHP9 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
SMPXQ9UHP9 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SMPXQ9UHP9 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SMPXQ9UHP9 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SMPXQ9UHP9 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SMPXQ9UHP9 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SMPXQ9UHP9 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SMPXQ9UHP9 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SMPXQ9UHP9 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SMPXQ9UHP9 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SMPXQ9UHP9 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SMPXQ9UHP9 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SMPXQ9UHP9 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SMPXQ9UHP9 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SMPXQ9UHP9 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SMPXQ9UHP9 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SMPXQ9UHP9 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SMPXQ9UHP9 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SMPXQ9UHP9 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SMPXQ9UHP9 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SMPXQ9UHP9 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SMPXQ9UHP9 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SMPXQ9UHP9 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SMPXQ9UHP9 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SMPXQ9UHP9 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SMPXQ9UHP9 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SMPXQ9UHP9 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SMPXQ9UHP9 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SMPXQ9UHP9 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SMPXQ9UHP9 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SMPXQ9UHP9 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SMPXQ9UHP9 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SMPXQ9UHP9 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SMPXQ9UHP9 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SMPXQ9UHP9 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SMPXQ9UHP9 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SMPXQ9UHP9 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SMPXQ9UHP9 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SMPXQ9UHP9 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SMPXQ9UHP9 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SMPXQ9UHP9 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
SMPXQ9UHP9 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SMPXQ9UHP9 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SMPXQ9UHP9 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SMPXQ9UHP9 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SMPXQ9UHP9 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SMPXQ9UHP9 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SMPXQ9UHP9 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SMPXQ9UHP9 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SMPXQ9UHP9 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SMPXQ9UHP9 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SMPXQ9UHP9 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SMPXQ9UHP9 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SMPXQ9UHP9 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SMPXQ9UHP9 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SMPXQ9UHP9 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SMPXQ9UHP9 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SMPXQ9UHP9 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SMPXQ9UHP9 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SMPXQ9UHP9 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SMPXQ9UHP9 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SMPXQ9UHP9 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SMPXQ9UHP9 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SMPXQ9UHP9 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SMPXQ9UHP9 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SMPXQ9UHP9 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
SMPXQ9UHP9 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SMPXQ9UHP9 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
SMPXQ9UHP9 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SMPXQ9UHP9 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SMPXQ9UHP9 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SMPXQ9UHP9 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
SMPXQ9UHP9 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SMPXQ9UHP9 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SMPXQ9UHP9 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
SMPXQ9UHP9 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
SMPXQ9UHP9 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SMPXQ9UHP9 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SMPXQ9UHP9 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.7 ms