Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHG2

PCSK1N, ProSAAS, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCSK1NQ9UHG2 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PCSK1NQ9UHG2 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PCSK1NQ9UHG2 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PCSK1NQ9UHG2 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PCSK1NQ9UHG2 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PCSK1NQ9UHG2 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PCSK1NQ9UHG2 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PCSK1NQ9UHG2 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PCSK1NQ9UHG2 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PCSK1NQ9UHG2 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PCSK1NQ9UHG2 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PCSK1NQ9UHG2 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PCSK1NQ9UHG2 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
PCSK1NQ9UHG2 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PCSK1NQ9UHG2 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PCSK1NQ9UHG2 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PCSK1NQ9UHG2 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PCSK1NQ9UHG2 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PCSK1NQ9UHG2 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PCSK1NQ9UHG2 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PCSK1NQ9UHG2 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PCSK1NQ9UHG2 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PCSK1NQ9UHG2 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PCSK1NQ9UHG2 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PCSK1NQ9UHG2 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PCSK1NQ9UHG2 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PCSK1NQ9UHG2 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PCSK1NQ9UHG2 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PCSK1NQ9UHG2 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PCSK1NQ9UHG2 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PCSK1NQ9UHG2 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PCSK1NQ9UHG2 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PCSK1NQ9UHG2 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PCSK1NQ9UHG2 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PCSK1NQ9UHG2 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PCSK1NQ9UHG2 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PCSK1NQ9UHG2 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PCSK1NQ9UHG2 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PCSK1NQ9UHG2 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PCSK1NQ9UHG2 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PCSK1NQ9UHG2 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PCSK1NQ9UHG2 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PCSK1NQ9UHG2 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PCSK1NQ9UHG2 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PCSK1NQ9UHG2 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PCSK1NQ9UHG2 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PCSK1NQ9UHG2 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PCSK1NQ9UHG2 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
PCSK1NQ9UHG2 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PCSK1NQ9UHG2 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PCSK1NQ9UHG2 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PCSK1NQ9UHG2 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PCSK1NQ9UHG2 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
PCSK1NQ9UHG2 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PCSK1NQ9UHG2 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PCSK1NQ9UHG2 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PCSK1NQ9UHG2 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PCSK1NQ9UHG2 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PCSK1NQ9UHG2 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PCSK1NQ9UHG2 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PCSK1NQ9UHG2 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PCSK1NQ9UHG2 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
PCSK1NQ9UHG2 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
PCSK1NQ9UHG2 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PCSK1NQ9UHG2 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PCSK1NQ9UHG2 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PCSK1NQ9UHG2 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PCSK1NQ9UHG2 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
PCSK1NQ9UHG2 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PCSK1NQ9UHG2 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PCSK1NQ9UHG2 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PCSK1NQ9UHG2 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PCSK1NQ9UHG2 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PCSK1NQ9UHG2 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PCSK1NQ9UHG2 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PCSK1NQ9UHG2 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
PCSK1NQ9UHG2 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PCSK1NQ9UHG2 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PCSK1NQ9UHG2 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PCSK1NQ9UHG2 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PCSK1NQ9UHG2 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PCSK1NQ9UHG2 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PCSK1NQ9UHG2 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PCSK1NQ9UHG2 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PCSK1NQ9UHG2 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PCSK1NQ9UHG2 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
PCSK1NQ9UHG2 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PCSK1NQ9UHG2 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PCSK1NQ9UHG2 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PCSK1NQ9UHG2 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PCSK1NQ9UHG2 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PCSK1NQ9UHG2 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PCSK1NQ9UHG2 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PCSK1NQ9UHG2 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PCSK1NQ9UHG2 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PCSK1NQ9UHG2 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PCSK1NQ9UHG2 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
PCSK1NQ9UHG2 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PCSK1NQ9UHG2 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PCSK1NQ9UHG2 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms