Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC3

ASIC3, Acid-sensing ion channel 3, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASIC3Q9UHC3 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ASIC3Q9UHC3 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ASIC3Q9UHC3 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ASIC3Q9UHC3 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ASIC3Q9UHC3 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
ASIC3Q9UHC3 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ASIC3Q9UHC3 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ASIC3Q9UHC3 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ASIC3Q9UHC3 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ASIC3Q9UHC3 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ASIC3Q9UHC3 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ASIC3Q9UHC3 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ASIC3Q9UHC3 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ASIC3Q9UHC3 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ASIC3Q9UHC3 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ASIC3Q9UHC3 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ASIC3Q9UHC3 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ASIC3Q9UHC3 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
ASIC3Q9UHC3 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
ASIC3Q9UHC3 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ASIC3Q9UHC3 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
ASIC3Q9UHC3 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ASIC3Q9UHC3 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ASIC3Q9UHC3 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ASIC3Q9UHC3 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ASIC3Q9UHC3 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ASIC3Q9UHC3 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ASIC3Q9UHC3 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ASIC3Q9UHC3 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ASIC3Q9UHC3 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ASIC3Q9UHC3 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ASIC3Q9UHC3 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ASIC3Q9UHC3 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ASIC3Q9UHC3 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ASIC3Q9UHC3 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ASIC3Q9UHC3 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ASIC3Q9UHC3 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ASIC3Q9UHC3 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ASIC3Q9UHC3 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ASIC3Q9UHC3 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ASIC3Q9UHC3 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ASIC3Q9UHC3 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ASIC3Q9UHC3 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ASIC3Q9UHC3 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ASIC3Q9UHC3 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ASIC3Q9UHC3 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ASIC3Q9UHC3 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ASIC3Q9UHC3 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ASIC3Q9UHC3 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ASIC3Q9UHC3 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ASIC3Q9UHC3 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ASIC3Q9UHC3 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ASIC3Q9UHC3 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ASIC3Q9UHC3 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
ASIC3Q9UHC3 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ASIC3Q9UHC3 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ASIC3Q9UHC3 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ASIC3Q9UHC3 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ASIC3Q9UHC3 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ASIC3Q9UHC3 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ASIC3Q9UHC3 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ASIC3Q9UHC3 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ASIC3Q9UHC3 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ASIC3Q9UHC3 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
ASIC3Q9UHC3 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ASIC3Q9UHC3 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ASIC3Q9UHC3 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ASIC3Q9UHC3 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ASIC3Q9UHC3 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ASIC3Q9UHC3 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ASIC3Q9UHC3 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ASIC3Q9UHC3 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ASIC3Q9UHC3 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ASIC3Q9UHC3 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ASIC3Q9UHC3 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ASIC3Q9UHC3 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ASIC3Q9UHC3 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
ASIC3Q9UHC3 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ASIC3Q9UHC3 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ASIC3Q9UHC3 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ASIC3Q9UHC3 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
ASIC3Q9UHC3 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.31
ASIC3Q9UHC3 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ASIC3Q9UHC3 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ASIC3Q9UHC3 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ASIC3Q9UHC3 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ASIC3Q9UHC3 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ASIC3Q9UHC3 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ASIC3Q9UHC3 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ASIC3Q9UHC3 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ASIC3Q9UHC3 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
ASIC3Q9UHC3 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ASIC3Q9UHC3 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ASIC3Q9UHC3 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ASIC3Q9UHC3 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ASIC3Q9UHC3 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ASIC3Q9UHC3 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ASIC3Q9UHC3 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ASIC3Q9UHC3 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ASIC3Q9UHC3 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms