Protein–RNA interactions for Protein: Q9UFF9

CNOT8, CCR4-NOT transcription complex subunit 8, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNOT8Q9UFF9 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CNOT8Q9UFF9 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CNOT8Q9UFF9 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CNOT8Q9UFF9 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CNOT8Q9UFF9 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CNOT8Q9UFF9 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CNOT8Q9UFF9 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CNOT8Q9UFF9 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CNOT8Q9UFF9 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CNOT8Q9UFF9 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CNOT8Q9UFF9 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CNOT8Q9UFF9 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CNOT8Q9UFF9 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CNOT8Q9UFF9 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CNOT8Q9UFF9 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CNOT8Q9UFF9 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
CNOT8Q9UFF9 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CNOT8Q9UFF9 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CNOT8Q9UFF9 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CNOT8Q9UFF9 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CNOT8Q9UFF9 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CNOT8Q9UFF9 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CNOT8Q9UFF9 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CNOT8Q9UFF9 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CNOT8Q9UFF9 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
CNOT8Q9UFF9 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
CNOT8Q9UFF9 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CNOT8Q9UFF9 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CNOT8Q9UFF9 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CNOT8Q9UFF9 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CNOT8Q9UFF9 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CNOT8Q9UFF9 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CNOT8Q9UFF9 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CNOT8Q9UFF9 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CNOT8Q9UFF9 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CNOT8Q9UFF9 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CNOT8Q9UFF9 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CNOT8Q9UFF9 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CNOT8Q9UFF9 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CNOT8Q9UFF9 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CNOT8Q9UFF9 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CNOT8Q9UFF9 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CNOT8Q9UFF9 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CNOT8Q9UFF9 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CNOT8Q9UFF9 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
CNOT8Q9UFF9 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CNOT8Q9UFF9 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CNOT8Q9UFF9 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CNOT8Q9UFF9 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CNOT8Q9UFF9 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CNOT8Q9UFF9 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CNOT8Q9UFF9 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CNOT8Q9UFF9 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CNOT8Q9UFF9 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CNOT8Q9UFF9 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CNOT8Q9UFF9 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CNOT8Q9UFF9 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CNOT8Q9UFF9 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CNOT8Q9UFF9 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CNOT8Q9UFF9 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CNOT8Q9UFF9 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CNOT8Q9UFF9 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CNOT8Q9UFF9 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CNOT8Q9UFF9 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CNOT8Q9UFF9 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CNOT8Q9UFF9 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CNOT8Q9UFF9 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CNOT8Q9UFF9 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CNOT8Q9UFF9 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CNOT8Q9UFF9 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
CNOT8Q9UFF9 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CNOT8Q9UFF9 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CNOT8Q9UFF9 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CNOT8Q9UFF9 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CNOT8Q9UFF9 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CNOT8Q9UFF9 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CNOT8Q9UFF9 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CNOT8Q9UFF9 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CNOT8Q9UFF9 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CNOT8Q9UFF9 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CNOT8Q9UFF9 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CNOT8Q9UFF9 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CNOT8Q9UFF9 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CNOT8Q9UFF9 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CNOT8Q9UFF9 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CNOT8Q9UFF9 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CNOT8Q9UFF9 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CNOT8Q9UFF9 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CNOT8Q9UFF9 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CNOT8Q9UFF9 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CNOT8Q9UFF9 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CNOT8Q9UFF9 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CNOT8Q9UFF9 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CNOT8Q9UFF9 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CNOT8Q9UFF9 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CNOT8Q9UFF9 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CNOT8Q9UFF9 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CNOT8Q9UFF9 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CNOT8Q9UFF9 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CNOT8Q9UFF9 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms