Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBN1

CACNG4, Voltage-dependent calcium channel gamma-4 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 327 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNG4Q9UBN1 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CACNG4Q9UBN1 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CACNG4Q9UBN1 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CACNG4Q9UBN1 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CACNG4Q9UBN1 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CACNG4Q9UBN1 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CACNG4Q9UBN1 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CACNG4Q9UBN1 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CACNG4Q9UBN1 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
CACNG4Q9UBN1 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CACNG4Q9UBN1 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CACNG4Q9UBN1 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CACNG4Q9UBN1 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CACNG4Q9UBN1 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CACNG4Q9UBN1 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
CACNG4Q9UBN1 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CACNG4Q9UBN1 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CACNG4Q9UBN1 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CACNG4Q9UBN1 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CACNG4Q9UBN1 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CACNG4Q9UBN1 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CACNG4Q9UBN1 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CACNG4Q9UBN1 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CACNG4Q9UBN1 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CACNG4Q9UBN1 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CACNG4Q9UBN1 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CACNG4Q9UBN1 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CACNG4Q9UBN1 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CACNG4Q9UBN1 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CACNG4Q9UBN1 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CACNG4Q9UBN1 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CACNG4Q9UBN1 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CACNG4Q9UBN1 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CACNG4Q9UBN1 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CACNG4Q9UBN1 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CACNG4Q9UBN1 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CACNG4Q9UBN1 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CACNG4Q9UBN1 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CACNG4Q9UBN1 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CACNG4Q9UBN1 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CACNG4Q9UBN1 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CACNG4Q9UBN1 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CACNG4Q9UBN1 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CACNG4Q9UBN1 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CACNG4Q9UBN1 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CACNG4Q9UBN1 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CACNG4Q9UBN1 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CACNG4Q9UBN1 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CACNG4Q9UBN1 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CACNG4Q9UBN1 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CACNG4Q9UBN1 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CACNG4Q9UBN1 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CACNG4Q9UBN1 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CACNG4Q9UBN1 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CACNG4Q9UBN1 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CACNG4Q9UBN1 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CACNG4Q9UBN1 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CACNG4Q9UBN1 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CACNG4Q9UBN1 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CACNG4Q9UBN1 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CACNG4Q9UBN1 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CACNG4Q9UBN1 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CACNG4Q9UBN1 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CACNG4Q9UBN1 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CACNG4Q9UBN1 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CACNG4Q9UBN1 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CACNG4Q9UBN1 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CACNG4Q9UBN1 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CACNG4Q9UBN1 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CACNG4Q9UBN1 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CACNG4Q9UBN1 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CACNG4Q9UBN1 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CACNG4Q9UBN1 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CACNG4Q9UBN1 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CACNG4Q9UBN1 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CACNG4Q9UBN1 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CACNG4Q9UBN1 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CACNG4Q9UBN1 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CACNG4Q9UBN1 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CACNG4Q9UBN1 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CACNG4Q9UBN1 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CACNG4Q9UBN1 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CACNG4Q9UBN1 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CACNG4Q9UBN1 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CACNG4Q9UBN1 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CACNG4Q9UBN1 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CACNG4Q9UBN1 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CACNG4Q9UBN1 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CACNG4Q9UBN1 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CACNG4Q9UBN1 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CACNG4Q9UBN1 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CACNG4Q9UBN1 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CACNG4Q9UBN1 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CACNG4Q9UBN1 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CACNG4Q9UBN1 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CACNG4Q9UBN1 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CACNG4Q9UBN1 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CACNG4Q9UBN1 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CACNG4Q9UBN1 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CACNG4Q9UBN1 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms