Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2R7

SUCLA2, Succinate--CoA ligase [ADP-forming] subunit beta, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 463 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUCLA2Q9P2R7 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SUCLA2Q9P2R7 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SUCLA2Q9P2R7 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SUCLA2Q9P2R7 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SUCLA2Q9P2R7 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SUCLA2Q9P2R7 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SUCLA2Q9P2R7 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SUCLA2Q9P2R7 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SUCLA2Q9P2R7 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SUCLA2Q9P2R7 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SUCLA2Q9P2R7 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SUCLA2Q9P2R7 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SUCLA2Q9P2R7 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SUCLA2Q9P2R7 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
SUCLA2Q9P2R7 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SUCLA2Q9P2R7 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SUCLA2Q9P2R7 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
SUCLA2Q9P2R7 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SUCLA2Q9P2R7 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SUCLA2Q9P2R7 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SUCLA2Q9P2R7 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SUCLA2Q9P2R7 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SUCLA2Q9P2R7 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SUCLA2Q9P2R7 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SUCLA2Q9P2R7 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SUCLA2Q9P2R7 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SUCLA2Q9P2R7 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
SUCLA2Q9P2R7 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
SUCLA2Q9P2R7 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SUCLA2Q9P2R7 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SUCLA2Q9P2R7 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SUCLA2Q9P2R7 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SUCLA2Q9P2R7 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SUCLA2Q9P2R7 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SUCLA2Q9P2R7 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SUCLA2Q9P2R7 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SUCLA2Q9P2R7 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SUCLA2Q9P2R7 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SUCLA2Q9P2R7 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SUCLA2Q9P2R7 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
SUCLA2Q9P2R7 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
SUCLA2Q9P2R7 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SUCLA2Q9P2R7 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SUCLA2Q9P2R7 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SUCLA2Q9P2R7 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SUCLA2Q9P2R7 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SUCLA2Q9P2R7 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SUCLA2Q9P2R7 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SUCLA2Q9P2R7 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SUCLA2Q9P2R7 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SUCLA2Q9P2R7 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SUCLA2Q9P2R7 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SUCLA2Q9P2R7 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SUCLA2Q9P2R7 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SUCLA2Q9P2R7 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SUCLA2Q9P2R7 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SUCLA2Q9P2R7 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SUCLA2Q9P2R7 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SUCLA2Q9P2R7 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SUCLA2Q9P2R7 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SUCLA2Q9P2R7 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
SUCLA2Q9P2R7 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
SUCLA2Q9P2R7 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SUCLA2Q9P2R7 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SUCLA2Q9P2R7 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SUCLA2Q9P2R7 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SUCLA2Q9P2R7 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SUCLA2Q9P2R7 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SUCLA2Q9P2R7 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
SUCLA2Q9P2R7 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SUCLA2Q9P2R7 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
SUCLA2Q9P2R7 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SUCLA2Q9P2R7 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SUCLA2Q9P2R7 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SUCLA2Q9P2R7 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
SUCLA2Q9P2R7 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SUCLA2Q9P2R7 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SUCLA2Q9P2R7 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SUCLA2Q9P2R7 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SUCLA2Q9P2R7 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SUCLA2Q9P2R7 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SUCLA2Q9P2R7 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SUCLA2Q9P2R7 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SUCLA2Q9P2R7 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SUCLA2Q9P2R7 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SUCLA2Q9P2R7 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SUCLA2Q9P2R7 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SUCLA2Q9P2R7 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SUCLA2Q9P2R7 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SUCLA2Q9P2R7 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
SUCLA2Q9P2R7 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SUCLA2Q9P2R7 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SUCLA2Q9P2R7 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SUCLA2Q9P2R7 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SUCLA2Q9P2R7 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SUCLA2Q9P2R7 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SUCLA2Q9P2R7 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SUCLA2Q9P2R7 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SUCLA2Q9P2R7 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
SUCLA2Q9P2R7 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.9 ms