Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2K3

RCOR3, REST corepressor 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCOR3Q9P2K3 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RCOR3Q9P2K3 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RCOR3Q9P2K3 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RCOR3Q9P2K3 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RCOR3Q9P2K3 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RCOR3Q9P2K3 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RCOR3Q9P2K3 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RCOR3Q9P2K3 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RCOR3Q9P2K3 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RCOR3Q9P2K3 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RCOR3Q9P2K3 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RCOR3Q9P2K3 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RCOR3Q9P2K3 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RCOR3Q9P2K3 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
RCOR3Q9P2K3 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RCOR3Q9P2K3 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RCOR3Q9P2K3 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RCOR3Q9P2K3 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RCOR3Q9P2K3 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RCOR3Q9P2K3 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RCOR3Q9P2K3 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RCOR3Q9P2K3 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RCOR3Q9P2K3 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RCOR3Q9P2K3 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RCOR3Q9P2K3 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RCOR3Q9P2K3 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RCOR3Q9P2K3 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
RCOR3Q9P2K3 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RCOR3Q9P2K3 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RCOR3Q9P2K3 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RCOR3Q9P2K3 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RCOR3Q9P2K3 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RCOR3Q9P2K3 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RCOR3Q9P2K3 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RCOR3Q9P2K3 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RCOR3Q9P2K3 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RCOR3Q9P2K3 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RCOR3Q9P2K3 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RCOR3Q9P2K3 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RCOR3Q9P2K3 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RCOR3Q9P2K3 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RCOR3Q9P2K3 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RCOR3Q9P2K3 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
RCOR3Q9P2K3 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RCOR3Q9P2K3 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RCOR3Q9P2K3 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RCOR3Q9P2K3 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RCOR3Q9P2K3 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RCOR3Q9P2K3 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RCOR3Q9P2K3 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RCOR3Q9P2K3 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RCOR3Q9P2K3 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RCOR3Q9P2K3 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RCOR3Q9P2K3 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RCOR3Q9P2K3 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RCOR3Q9P2K3 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RCOR3Q9P2K3 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RCOR3Q9P2K3 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RCOR3Q9P2K3 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
RCOR3Q9P2K3 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
RCOR3Q9P2K3 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RCOR3Q9P2K3 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RCOR3Q9P2K3 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RCOR3Q9P2K3 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RCOR3Q9P2K3 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RCOR3Q9P2K3 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RCOR3Q9P2K3 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RCOR3Q9P2K3 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RCOR3Q9P2K3 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RCOR3Q9P2K3 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RCOR3Q9P2K3 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RCOR3Q9P2K3 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RCOR3Q9P2K3 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RCOR3Q9P2K3 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RCOR3Q9P2K3 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RCOR3Q9P2K3 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RCOR3Q9P2K3 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RCOR3Q9P2K3 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RCOR3Q9P2K3 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RCOR3Q9P2K3 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RCOR3Q9P2K3 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RCOR3Q9P2K3 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RCOR3Q9P2K3 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RCOR3Q9P2K3 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RCOR3Q9P2K3 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
RCOR3Q9P2K3 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RCOR3Q9P2K3 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RCOR3Q9P2K3 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RCOR3Q9P2K3 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RCOR3Q9P2K3 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RCOR3Q9P2K3 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RCOR3Q9P2K3 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RCOR3Q9P2K3 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RCOR3Q9P2K3 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RCOR3Q9P2K3 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RCOR3Q9P2K3 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RCOR3Q9P2K3 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RCOR3Q9P2K3 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RCOR3Q9P2K3 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RCOR3Q9P2K3 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 173.5 ms