Protein–RNA interactions for Protein: Q9P253

VPS18, Vacuolar protein sorting-associated protein 18 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 973 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS18Q9P253 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
VPS18Q9P253 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
VPS18Q9P253 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
VPS18Q9P253 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
VPS18Q9P253 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
VPS18Q9P253 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
VPS18Q9P253 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
VPS18Q9P253 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
VPS18Q9P253 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
VPS18Q9P253 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
VPS18Q9P253 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
VPS18Q9P253 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
VPS18Q9P253 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
VPS18Q9P253 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
VPS18Q9P253 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
VPS18Q9P253 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
VPS18Q9P253 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
VPS18Q9P253 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
VPS18Q9P253 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
VPS18Q9P253 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
VPS18Q9P253 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
VPS18Q9P253 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
VPS18Q9P253 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
VPS18Q9P253 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
VPS18Q9P253 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
VPS18Q9P253 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
VPS18Q9P253 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
VPS18Q9P253 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
VPS18Q9P253 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
VPS18Q9P253 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
VPS18Q9P253 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
VPS18Q9P253 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
VPS18Q9P253 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
VPS18Q9P253 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
VPS18Q9P253 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
VPS18Q9P253 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
VPS18Q9P253 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
VPS18Q9P253 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
VPS18Q9P253 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
VPS18Q9P253 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
VPS18Q9P253 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
VPS18Q9P253 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
VPS18Q9P253 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
VPS18Q9P253 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
VPS18Q9P253 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
VPS18Q9P253 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
VPS18Q9P253 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
VPS18Q9P253 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
VPS18Q9P253 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
VPS18Q9P253 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
VPS18Q9P253 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
VPS18Q9P253 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
VPS18Q9P253 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
VPS18Q9P253 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
VPS18Q9P253 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
VPS18Q9P253 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
VPS18Q9P253 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
VPS18Q9P253 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
VPS18Q9P253 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
VPS18Q9P253 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
VPS18Q9P253 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
VPS18Q9P253 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
VPS18Q9P253 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
VPS18Q9P253 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
VPS18Q9P253 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
VPS18Q9P253 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
VPS18Q9P253 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
VPS18Q9P253 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
VPS18Q9P253 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
VPS18Q9P253 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
VPS18Q9P253 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
VPS18Q9P253 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
VPS18Q9P253 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
VPS18Q9P253 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
VPS18Q9P253 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
VPS18Q9P253 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
VPS18Q9P253 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
VPS18Q9P253 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
VPS18Q9P253 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
VPS18Q9P253 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
VPS18Q9P253 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
VPS18Q9P253 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
VPS18Q9P253 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
VPS18Q9P253 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
VPS18Q9P253 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
VPS18Q9P253 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
VPS18Q9P253 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
VPS18Q9P253 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
VPS18Q9P253 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
VPS18Q9P253 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
VPS18Q9P253 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
VPS18Q9P253 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
VPS18Q9P253 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
VPS18Q9P253 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
VPS18Q9P253 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
VPS18Q9P253 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
VPS18Q9P253 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
VPS18Q9P253 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
VPS18Q9P253 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
VPS18Q9P253 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms