Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0V3

SH3BP4, SH3 domain-binding protein 4, humanhuman

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Length 963 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4Q9P0V3 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SH3BP4Q9P0V3 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SH3BP4Q9P0V3 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SH3BP4Q9P0V3 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SH3BP4Q9P0V3 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SH3BP4Q9P0V3 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SH3BP4Q9P0V3 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SH3BP4Q9P0V3 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SH3BP4Q9P0V3 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
SH3BP4Q9P0V3 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SH3BP4Q9P0V3 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SH3BP4Q9P0V3 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SH3BP4Q9P0V3 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SH3BP4Q9P0V3 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SH3BP4Q9P0V3 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SH3BP4Q9P0V3 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SH3BP4Q9P0V3 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SH3BP4Q9P0V3 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SH3BP4Q9P0V3 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
SH3BP4Q9P0V3 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SH3BP4Q9P0V3 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SH3BP4Q9P0V3 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SH3BP4Q9P0V3 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SH3BP4Q9P0V3 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SH3BP4Q9P0V3 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SH3BP4Q9P0V3 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SH3BP4Q9P0V3 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SH3BP4Q9P0V3 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SH3BP4Q9P0V3 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SH3BP4Q9P0V3 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SH3BP4Q9P0V3 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SH3BP4Q9P0V3 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SH3BP4Q9P0V3 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SH3BP4Q9P0V3 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SH3BP4Q9P0V3 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SH3BP4Q9P0V3 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SH3BP4Q9P0V3 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SH3BP4Q9P0V3 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SH3BP4Q9P0V3 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SH3BP4Q9P0V3 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SH3BP4Q9P0V3 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SH3BP4Q9P0V3 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SH3BP4Q9P0V3 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SH3BP4Q9P0V3 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SH3BP4Q9P0V3 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SH3BP4Q9P0V3 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SH3BP4Q9P0V3 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SH3BP4Q9P0V3 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SH3BP4Q9P0V3 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SH3BP4Q9P0V3 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SH3BP4Q9P0V3 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SH3BP4Q9P0V3 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SH3BP4Q9P0V3 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SH3BP4Q9P0V3 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SH3BP4Q9P0V3 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SH3BP4Q9P0V3 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SH3BP4Q9P0V3 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SH3BP4Q9P0V3 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SH3BP4Q9P0V3 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
SH3BP4Q9P0V3 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SH3BP4Q9P0V3 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SH3BP4Q9P0V3 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SH3BP4Q9P0V3 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SH3BP4Q9P0V3 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SH3BP4Q9P0V3 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
SH3BP4Q9P0V3 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SH3BP4Q9P0V3 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SH3BP4Q9P0V3 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SH3BP4Q9P0V3 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SH3BP4Q9P0V3 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SH3BP4Q9P0V3 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SH3BP4Q9P0V3 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SH3BP4Q9P0V3 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SH3BP4Q9P0V3 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SH3BP4Q9P0V3 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SH3BP4Q9P0V3 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SH3BP4Q9P0V3 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SH3BP4Q9P0V3 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SH3BP4Q9P0V3 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SH3BP4Q9P0V3 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SH3BP4Q9P0V3 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SH3BP4Q9P0V3 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SH3BP4Q9P0V3 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SH3BP4Q9P0V3 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SH3BP4Q9P0V3 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SH3BP4Q9P0V3 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SH3BP4Q9P0V3 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SH3BP4Q9P0V3 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SH3BP4Q9P0V3 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SH3BP4Q9P0V3 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SH3BP4Q9P0V3 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SH3BP4Q9P0V3 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SH3BP4Q9P0V3 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SH3BP4Q9P0V3 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SH3BP4Q9P0V3 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SH3BP4Q9P0V3 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SH3BP4Q9P0V3 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SH3BP4Q9P0V3 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SH3BP4Q9P0V3 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SH3BP4Q9P0V3 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
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