Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0U3

SENP1, Sentrin-specific protease 1, humanhuman

Predictions only

Length 644 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP1Q9P0U3 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SENP1Q9P0U3 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SENP1Q9P0U3 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SENP1Q9P0U3 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SENP1Q9P0U3 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SENP1Q9P0U3 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SENP1Q9P0U3 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SENP1Q9P0U3 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SENP1Q9P0U3 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SENP1Q9P0U3 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SENP1Q9P0U3 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SENP1Q9P0U3 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SENP1Q9P0U3 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SENP1Q9P0U3 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SENP1Q9P0U3 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SENP1Q9P0U3 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SENP1Q9P0U3 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SENP1Q9P0U3 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SENP1Q9P0U3 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SENP1Q9P0U3 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SENP1Q9P0U3 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SENP1Q9P0U3 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SENP1Q9P0U3 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SENP1Q9P0U3 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SENP1Q9P0U3 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SENP1Q9P0U3 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SENP1Q9P0U3 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SENP1Q9P0U3 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SENP1Q9P0U3 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SENP1Q9P0U3 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SENP1Q9P0U3 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SENP1Q9P0U3 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SENP1Q9P0U3 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SENP1Q9P0U3 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SENP1Q9P0U3 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SENP1Q9P0U3 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SENP1Q9P0U3 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SENP1Q9P0U3 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SENP1Q9P0U3 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SENP1Q9P0U3 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SENP1Q9P0U3 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SENP1Q9P0U3 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SENP1Q9P0U3 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SENP1Q9P0U3 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SENP1Q9P0U3 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SENP1Q9P0U3 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SENP1Q9P0U3 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SENP1Q9P0U3 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SENP1Q9P0U3 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SENP1Q9P0U3 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SENP1Q9P0U3 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SENP1Q9P0U3 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SENP1Q9P0U3 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SENP1Q9P0U3 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SENP1Q9P0U3 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SENP1Q9P0U3 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SENP1Q9P0U3 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SENP1Q9P0U3 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SENP1Q9P0U3 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SENP1Q9P0U3 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SENP1Q9P0U3 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SENP1Q9P0U3 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SENP1Q9P0U3 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SENP1Q9P0U3 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SENP1Q9P0U3 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SENP1Q9P0U3 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SENP1Q9P0U3 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SENP1Q9P0U3 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SENP1Q9P0U3 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SENP1Q9P0U3 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SENP1Q9P0U3 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SENP1Q9P0U3 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SENP1Q9P0U3 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SENP1Q9P0U3 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SENP1Q9P0U3 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SENP1Q9P0U3 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SENP1Q9P0U3 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SENP1Q9P0U3 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SENP1Q9P0U3 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SENP1Q9P0U3 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SENP1Q9P0U3 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SENP1Q9P0U3 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SENP1Q9P0U3 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SENP1Q9P0U3 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SENP1Q9P0U3 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SENP1Q9P0U3 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SENP1Q9P0U3 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SENP1Q9P0U3 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SENP1Q9P0U3 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SENP1Q9P0U3 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SENP1Q9P0U3 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SENP1Q9P0U3 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SENP1Q9P0U3 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SENP1Q9P0U3 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SENP1Q9P0U3 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SENP1Q9P0U3 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SENP1Q9P0U3 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SENP1Q9P0U3 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SENP1Q9P0U3 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SENP1Q9P0U3 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 163.3 ms