Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZZ3

CHMP5, Charged multivesicular body protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP5Q9NZZ3 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CHMP5Q9NZZ3 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CHMP5Q9NZZ3 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CHMP5Q9NZZ3 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CHMP5Q9NZZ3 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CHMP5Q9NZZ3 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CHMP5Q9NZZ3 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
CHMP5Q9NZZ3 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CHMP5Q9NZZ3 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CHMP5Q9NZZ3 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CHMP5Q9NZZ3 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CHMP5Q9NZZ3 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CHMP5Q9NZZ3 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CHMP5Q9NZZ3 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CHMP5Q9NZZ3 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CHMP5Q9NZZ3 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CHMP5Q9NZZ3 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CHMP5Q9NZZ3 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CHMP5Q9NZZ3 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CHMP5Q9NZZ3 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CHMP5Q9NZZ3 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CHMP5Q9NZZ3 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CHMP5Q9NZZ3 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CHMP5Q9NZZ3 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CHMP5Q9NZZ3 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
CHMP5Q9NZZ3 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
CHMP5Q9NZZ3 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CHMP5Q9NZZ3 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CHMP5Q9NZZ3 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
CHMP5Q9NZZ3 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CHMP5Q9NZZ3 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CHMP5Q9NZZ3 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CHMP5Q9NZZ3 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CHMP5Q9NZZ3 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CHMP5Q9NZZ3 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
CHMP5Q9NZZ3 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CHMP5Q9NZZ3 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CHMP5Q9NZZ3 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CHMP5Q9NZZ3 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CHMP5Q9NZZ3 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CHMP5Q9NZZ3 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CHMP5Q9NZZ3 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CHMP5Q9NZZ3 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CHMP5Q9NZZ3 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CHMP5Q9NZZ3 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CHMP5Q9NZZ3 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CHMP5Q9NZZ3 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CHMP5Q9NZZ3 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CHMP5Q9NZZ3 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CHMP5Q9NZZ3 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CHMP5Q9NZZ3 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CHMP5Q9NZZ3 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
CHMP5Q9NZZ3 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CHMP5Q9NZZ3 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CHMP5Q9NZZ3 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CHMP5Q9NZZ3 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CHMP5Q9NZZ3 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CHMP5Q9NZZ3 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CHMP5Q9NZZ3 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CHMP5Q9NZZ3 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CHMP5Q9NZZ3 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CHMP5Q9NZZ3 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CHMP5Q9NZZ3 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CHMP5Q9NZZ3 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CHMP5Q9NZZ3 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CHMP5Q9NZZ3 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CHMP5Q9NZZ3 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CHMP5Q9NZZ3 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CHMP5Q9NZZ3 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CHMP5Q9NZZ3 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CHMP5Q9NZZ3 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CHMP5Q9NZZ3 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CHMP5Q9NZZ3 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
CHMP5Q9NZZ3 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CHMP5Q9NZZ3 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CHMP5Q9NZZ3 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CHMP5Q9NZZ3 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CHMP5Q9NZZ3 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CHMP5Q9NZZ3 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CHMP5Q9NZZ3 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CHMP5Q9NZZ3 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CHMP5Q9NZZ3 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CHMP5Q9NZZ3 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
CHMP5Q9NZZ3 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CHMP5Q9NZZ3 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CHMP5Q9NZZ3 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CHMP5Q9NZZ3 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CHMP5Q9NZZ3 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CHMP5Q9NZZ3 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CHMP5Q9NZZ3 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CHMP5Q9NZZ3 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
CHMP5Q9NZZ3 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CHMP5Q9NZZ3 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CHMP5Q9NZZ3 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CHMP5Q9NZZ3 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CHMP5Q9NZZ3 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CHMP5Q9NZZ3 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CHMP5Q9NZZ3 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CHMP5Q9NZZ3 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CHMP5Q9NZZ3 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms