Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZM5

NOP53, Ribosome biogenesis protein NOP53, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOP53Q9NZM5 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
NOP53Q9NZM5 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NOP53Q9NZM5 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NOP53Q9NZM5 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NOP53Q9NZM5 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NOP53Q9NZM5 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NOP53Q9NZM5 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NOP53Q9NZM5 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NOP53Q9NZM5 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NOP53Q9NZM5 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NOP53Q9NZM5 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NOP53Q9NZM5 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NOP53Q9NZM5 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NOP53Q9NZM5 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NOP53Q9NZM5 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NOP53Q9NZM5 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NOP53Q9NZM5 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NOP53Q9NZM5 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NOP53Q9NZM5 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NOP53Q9NZM5 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NOP53Q9NZM5 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
NOP53Q9NZM5 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NOP53Q9NZM5 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NOP53Q9NZM5 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NOP53Q9NZM5 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NOP53Q9NZM5 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NOP53Q9NZM5 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NOP53Q9NZM5 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NOP53Q9NZM5 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NOP53Q9NZM5 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NOP53Q9NZM5 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NOP53Q9NZM5 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NOP53Q9NZM5 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NOP53Q9NZM5 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NOP53Q9NZM5 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NOP53Q9NZM5 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NOP53Q9NZM5 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NOP53Q9NZM5 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NOP53Q9NZM5 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NOP53Q9NZM5 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NOP53Q9NZM5 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NOP53Q9NZM5 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NOP53Q9NZM5 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
NOP53Q9NZM5 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
NOP53Q9NZM5 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NOP53Q9NZM5 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NOP53Q9NZM5 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NOP53Q9NZM5 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NOP53Q9NZM5 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NOP53Q9NZM5 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NOP53Q9NZM5 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NOP53Q9NZM5 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NOP53Q9NZM5 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NOP53Q9NZM5 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NOP53Q9NZM5 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NOP53Q9NZM5 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NOP53Q9NZM5 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NOP53Q9NZM5 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NOP53Q9NZM5 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NOP53Q9NZM5 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NOP53Q9NZM5 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NOP53Q9NZM5 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NOP53Q9NZM5 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NOP53Q9NZM5 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NOP53Q9NZM5 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NOP53Q9NZM5 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NOP53Q9NZM5 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NOP53Q9NZM5 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NOP53Q9NZM5 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NOP53Q9NZM5 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NOP53Q9NZM5 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NOP53Q9NZM5 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NOP53Q9NZM5 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NOP53Q9NZM5 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NOP53Q9NZM5 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NOP53Q9NZM5 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NOP53Q9NZM5 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NOP53Q9NZM5 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NOP53Q9NZM5 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NOP53Q9NZM5 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NOP53Q9NZM5 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NOP53Q9NZM5 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NOP53Q9NZM5 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NOP53Q9NZM5 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NOP53Q9NZM5 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NOP53Q9NZM5 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NOP53Q9NZM5 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NOP53Q9NZM5 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NOP53Q9NZM5 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NOP53Q9NZM5 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NOP53Q9NZM5 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NOP53Q9NZM5 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NOP53Q9NZM5 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NOP53Q9NZM5 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NOP53Q9NZM5 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NOP53Q9NZM5 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NOP53Q9NZM5 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NOP53Q9NZM5 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
NOP53Q9NZM5 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NOP53Q9NZM5 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms