Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY47

CACNA2D2, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D2Q9NY47 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CACNA2D2Q9NY47 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CACNA2D2Q9NY47 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CACNA2D2Q9NY47 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CACNA2D2Q9NY47 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CACNA2D2Q9NY47 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CACNA2D2Q9NY47 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CACNA2D2Q9NY47 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CACNA2D2Q9NY47 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CACNA2D2Q9NY47 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CACNA2D2Q9NY47 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CACNA2D2Q9NY47 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CACNA2D2Q9NY47 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CACNA2D2Q9NY47 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CACNA2D2Q9NY47 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CACNA2D2Q9NY47 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CACNA2D2Q9NY47 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CACNA2D2Q9NY47 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CACNA2D2Q9NY47 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CACNA2D2Q9NY47 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CACNA2D2Q9NY47 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CACNA2D2Q9NY47 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CACNA2D2Q9NY47 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CACNA2D2Q9NY47 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CACNA2D2Q9NY47 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CACNA2D2Q9NY47 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CACNA2D2Q9NY47 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CACNA2D2Q9NY47 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CACNA2D2Q9NY47 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CACNA2D2Q9NY47 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CACNA2D2Q9NY47 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CACNA2D2Q9NY47 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CACNA2D2Q9NY47 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CACNA2D2Q9NY47 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CACNA2D2Q9NY47 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CACNA2D2Q9NY47 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CACNA2D2Q9NY47 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CACNA2D2Q9NY47 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
CACNA2D2Q9NY47 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CACNA2D2Q9NY47 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CACNA2D2Q9NY47 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CACNA2D2Q9NY47 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CACNA2D2Q9NY47 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CACNA2D2Q9NY47 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CACNA2D2Q9NY47 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CACNA2D2Q9NY47 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CACNA2D2Q9NY47 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CACNA2D2Q9NY47 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CACNA2D2Q9NY47 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CACNA2D2Q9NY47 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CACNA2D2Q9NY47 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CACNA2D2Q9NY47 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CACNA2D2Q9NY47 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CACNA2D2Q9NY47 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CACNA2D2Q9NY47 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CACNA2D2Q9NY47 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CACNA2D2Q9NY47 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CACNA2D2Q9NY47 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CACNA2D2Q9NY47 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CACNA2D2Q9NY47 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CACNA2D2Q9NY47 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CACNA2D2Q9NY47 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CACNA2D2Q9NY47 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CACNA2D2Q9NY47 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CACNA2D2Q9NY47 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CACNA2D2Q9NY47 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CACNA2D2Q9NY47 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CACNA2D2Q9NY47 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CACNA2D2Q9NY47 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CACNA2D2Q9NY47 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CACNA2D2Q9NY47 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CACNA2D2Q9NY47 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CACNA2D2Q9NY47 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CACNA2D2Q9NY47 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CACNA2D2Q9NY47 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CACNA2D2Q9NY47 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CACNA2D2Q9NY47 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CACNA2D2Q9NY47 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CACNA2D2Q9NY47 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CACNA2D2Q9NY47 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CACNA2D2Q9NY47 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CACNA2D2Q9NY47 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CACNA2D2Q9NY47 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CACNA2D2Q9NY47 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CACNA2D2Q9NY47 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CACNA2D2Q9NY47 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CACNA2D2Q9NY47 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CACNA2D2Q9NY47 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CACNA2D2Q9NY47 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CACNA2D2Q9NY47 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CACNA2D2Q9NY47 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CACNA2D2Q9NY47 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CACNA2D2Q9NY47 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CACNA2D2Q9NY47 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CACNA2D2Q9NY47 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CACNA2D2Q9NY47 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CACNA2D2Q9NY47 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CACNA2D2Q9NY47 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CACNA2D2Q9NY47 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CACNA2D2Q9NY47 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms