Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXZ2

DDX43, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX43, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX43Q9NXZ2 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
DDX43Q9NXZ2 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
DDX43Q9NXZ2 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
DDX43Q9NXZ2 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
DDX43Q9NXZ2 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
DDX43Q9NXZ2 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
DDX43Q9NXZ2 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
DDX43Q9NXZ2 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
DDX43Q9NXZ2 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
DDX43Q9NXZ2 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
DDX43Q9NXZ2 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
DDX43Q9NXZ2 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
DDX43Q9NXZ2 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
DDX43Q9NXZ2 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
DDX43Q9NXZ2 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
DDX43Q9NXZ2 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
DDX43Q9NXZ2 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
DDX43Q9NXZ2 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
DDX43Q9NXZ2 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
DDX43Q9NXZ2 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
DDX43Q9NXZ2 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
DDX43Q9NXZ2 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
DDX43Q9NXZ2 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
DDX43Q9NXZ2 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
DDX43Q9NXZ2 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
DDX43Q9NXZ2 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
DDX43Q9NXZ2 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
DDX43Q9NXZ2 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
DDX43Q9NXZ2 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
DDX43Q9NXZ2 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
DDX43Q9NXZ2 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
DDX43Q9NXZ2 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
DDX43Q9NXZ2 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
DDX43Q9NXZ2 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
DDX43Q9NXZ2 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
DDX43Q9NXZ2 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
DDX43Q9NXZ2 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
DDX43Q9NXZ2 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
DDX43Q9NXZ2 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
DDX43Q9NXZ2 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
DDX43Q9NXZ2 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
DDX43Q9NXZ2 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
DDX43Q9NXZ2 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
DDX43Q9NXZ2 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
DDX43Q9NXZ2 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
DDX43Q9NXZ2 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
DDX43Q9NXZ2 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
DDX43Q9NXZ2 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
DDX43Q9NXZ2 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
DDX43Q9NXZ2 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
DDX43Q9NXZ2 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
DDX43Q9NXZ2 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
DDX43Q9NXZ2 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
DDX43Q9NXZ2 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
DDX43Q9NXZ2 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
DDX43Q9NXZ2 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
DDX43Q9NXZ2 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
DDX43Q9NXZ2 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
DDX43Q9NXZ2 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
DDX43Q9NXZ2 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
DDX43Q9NXZ2 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
DDX43Q9NXZ2 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
DDX43Q9NXZ2 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
DDX43Q9NXZ2 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
DDX43Q9NXZ2 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
DDX43Q9NXZ2 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
DDX43Q9NXZ2 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
DDX43Q9NXZ2 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
DDX43Q9NXZ2 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
DDX43Q9NXZ2 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
DDX43Q9NXZ2 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
DDX43Q9NXZ2 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
DDX43Q9NXZ2 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
DDX43Q9NXZ2 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
DDX43Q9NXZ2 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
DDX43Q9NXZ2 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
DDX43Q9NXZ2 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
DDX43Q9NXZ2 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
DDX43Q9NXZ2 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
DDX43Q9NXZ2 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
DDX43Q9NXZ2 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
DDX43Q9NXZ2 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
DDX43Q9NXZ2 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
DDX43Q9NXZ2 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
DDX43Q9NXZ2 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
DDX43Q9NXZ2 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
DDX43Q9NXZ2 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
DDX43Q9NXZ2 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
DDX43Q9NXZ2 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
DDX43Q9NXZ2 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
DDX43Q9NXZ2 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
DDX43Q9NXZ2 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
DDX43Q9NXZ2 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
DDX43Q9NXZ2 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
DDX43Q9NXZ2 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
DDX43Q9NXZ2 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
DDX43Q9NXZ2 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
DDX43Q9NXZ2 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
DDX43Q9NXZ2 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
DDX43Q9NXZ2 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms